Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DSG3P32926 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DSG3P32926 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DSG3P32926 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DSG3P32926 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DSG3P32926 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
DSG3P32926 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DSG3P32926 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DSG3P32926 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DSG3P32926 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DSG3P32926 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DSG3P32926 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DSG3P32926 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DSG3P32926 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
DSG3P32926 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DSG3P32926 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DSG3P32926 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DSG3P32926 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DSG3P32926 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DSG3P32926 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DSG3P32926 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DSG3P32926 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DSG3P32926 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DSG3P32926 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DSG3P32926 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DSG3P32926 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DSG3P32926 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DSG3P32926 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DSG3P32926 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DSG3P32926 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DSG3P32926 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DSG3P32926 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DSG3P32926 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DSG3P32926 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DSG3P32926 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DSG3P32926 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DSG3P32926 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DSG3P32926 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
DSG3P32926 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DSG3P32926 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DSG3P32926 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DSG3P32926 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DSG3P32926 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DSG3P32926 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DSG3P32926 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DSG3P32926 KRTAP4-4-201ENST00000390661 1081 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DSG3P32926 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DSG3P32926 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DSG3P32926 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DSG3P32926 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DSG3P32926 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DSG3P32926 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DSG3P32926 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DSG3P32926 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DSG3P32926 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DSG3P32926 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DSG3P32926 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DSG3P32926 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
DSG3P32926 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DSG3P32926 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DSG3P32926 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DSG3P32926 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DSG3P32926 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
DSG3P32926 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DSG3P32926 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DSG3P32926 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DSG3P32926 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DSG3P32926 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DSG3P32926 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DSG3P32926 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DSG3P32926 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DSG3P32926 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DSG3P32926 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DSG3P32926 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DSG3P32926 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DSG3P32926 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DSG3P32926 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DSG3P32926 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DSG3P32926 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DSG3P32926 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DSG3P32926 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DSG3P32926 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DSG3P32926 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DSG3P32926 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DSG3P32926 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DSG3P32926 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DSG3P32926 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DSG3P32926 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DSG3P32926 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DSG3P32926 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
DSG3P32926 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DSG3P32926 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DSG3P32926 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DSG3P32926 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DSG3P32926 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DSG3P32926 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DSG3P32926 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DSG3P32926 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DSG3P32926 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
DSG3P32926 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms