Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCKBRP32239 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCKBRP32239 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCKBRP32239 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCKBRP32239 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCKBRP32239 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCKBRP32239 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCKBRP32239 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCKBRP32239 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCKBRP32239 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCKBRP32239 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCKBRP32239 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCKBRP32239 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCKBRP32239 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCKBRP32239 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCKBRP32239 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCKBRP32239 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CCKBRP32239 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCKBRP32239 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCKBRP32239 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCKBRP32239 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCKBRP32239 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCKBRP32239 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCKBRP32239 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCKBRP32239 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCKBRP32239 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCKBRP32239 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCKBRP32239 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCKBRP32239 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCKBRP32239 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCKBRP32239 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCKBRP32239 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCKBRP32239 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCKBRP32239 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCKBRP32239 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCKBRP32239 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCKBRP32239 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCKBRP32239 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCKBRP32239 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCKBRP32239 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCKBRP32239 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCKBRP32239 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCKBRP32239 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCKBRP32239 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCKBRP32239 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCKBRP32239 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCKBRP32239 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCKBRP32239 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCKBRP32239 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCKBRP32239 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCKBRP32239 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCKBRP32239 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCKBRP32239 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCKBRP32239 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCKBRP32239 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCKBRP32239 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCKBRP32239 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCKBRP32239 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCKBRP32239 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCKBRP32239 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCKBRP32239 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCKBRP32239 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCKBRP32239 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCKBRP32239 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCKBRP32239 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCKBRP32239 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCKBRP32239 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCKBRP32239 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCKBRP32239 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCKBRP32239 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCKBRP32239 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCKBRP32239 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCKBRP32239 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCKBRP32239 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCKBRP32239 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCKBRP32239 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCKBRP32239 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCKBRP32239 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCKBRP32239 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCKBRP32239 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCKBRP32239 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCKBRP32239 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCKBRP32239 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCKBRP32239 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCKBRP32239 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCKBRP32239 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCKBRP32239 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCKBRP32239 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCKBRP32239 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCKBRP32239 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCKBRP32239 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCKBRP32239 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCKBRP32239 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCKBRP32239 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCKBRP32239 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCKBRP32239 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCKBRP32239 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCKBRP32239 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCKBRP32239 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCKBRP32239 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms