Protein–RNA interactions for Protein: P29590

PML, Protein PML, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMLP29590 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PMLP29590 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PMLP29590 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PMLP29590 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PMLP29590 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PMLP29590 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PMLP29590 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PMLP29590 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PMLP29590 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PMLP29590 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PMLP29590 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PMLP29590 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PMLP29590 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PMLP29590 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PMLP29590 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PMLP29590 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PMLP29590 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PMLP29590 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PMLP29590 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PMLP29590 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PMLP29590 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PMLP29590 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PMLP29590 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PMLP29590 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PMLP29590 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PMLP29590 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PMLP29590 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PMLP29590 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PMLP29590 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PMLP29590 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PMLP29590 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PMLP29590 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PMLP29590 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PMLP29590 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PMLP29590 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PMLP29590 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PMLP29590 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PMLP29590 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PMLP29590 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PMLP29590 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PMLP29590 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PMLP29590 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PMLP29590 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PMLP29590 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PMLP29590 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PMLP29590 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PMLP29590 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PMLP29590 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PMLP29590 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PMLP29590 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PMLP29590 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PMLP29590 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PMLP29590 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PMLP29590 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PMLP29590 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PMLP29590 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PMLP29590 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PMLP29590 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PMLP29590 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PMLP29590 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PMLP29590 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PMLP29590 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PMLP29590 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PMLP29590 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PMLP29590 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PMLP29590 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PMLP29590 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PMLP29590 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PMLP29590 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PMLP29590 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PMLP29590 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PMLP29590 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PMLP29590 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PMLP29590 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PMLP29590 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PMLP29590 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PMLP29590 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PMLP29590 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PMLP29590 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PMLP29590 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PMLP29590 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PMLP29590 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PMLP29590 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PMLP29590 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PMLP29590 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PMLP29590 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PMLP29590 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PMLP29590 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PMLP29590 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PMLP29590 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PMLP29590 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PMLP29590 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PMLP29590 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PMLP29590 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PMLP29590 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PMLP29590 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PMLP29590 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PMLP29590 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PMLP29590 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PMLP29590 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms