Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABRB3P28472 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRB3P28472 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRB3P28472 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRB3P28472 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRB3P28472 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRB3P28472 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRB3P28472 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRB3P28472 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRB3P28472 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRB3P28472 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRB3P28472 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRB3P28472 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRB3P28472 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRB3P28472 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRB3P28472 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRB3P28472 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRB3P28472 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRB3P28472 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRB3P28472 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRB3P28472 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRB3P28472 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRB3P28472 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRB3P28472 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABRB3P28472 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABRB3P28472 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABRB3P28472 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABRB3P28472 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABRB3P28472 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABRB3P28472 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABRB3P28472 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABRB3P28472 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABRB3P28472 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABRB3P28472 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABRB3P28472 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABRB3P28472 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABRB3P28472 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABRB3P28472 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABRB3P28472 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABRB3P28472 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABRB3P28472 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GABRB3P28472 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABRB3P28472 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABRB3P28472 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABRB3P28472 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABRB3P28472 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABRB3P28472 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABRB3P28472 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
GABRB3P28472 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABRB3P28472 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABRB3P28472 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABRB3P28472 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABRB3P28472 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABRB3P28472 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABRB3P28472 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABRB3P28472 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GABRB3P28472 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABRB3P28472 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABRB3P28472 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABRB3P28472 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABRB3P28472 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABRB3P28472 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABRB3P28472 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABRB3P28472 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABRB3P28472 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GABRB3P28472 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GABRB3P28472 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GABRB3P28472 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GABRB3P28472 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GABRB3P28472 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GABRB3P28472 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GABRB3P28472 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GABRB3P28472 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GABRB3P28472 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GABRB3P28472 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GABRB3P28472 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GABRB3P28472 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GABRB3P28472 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GABRB3P28472 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GABRB3P28472 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GABRB3P28472 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GABRB3P28472 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GABRB3P28472 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GABRB3P28472 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GABRB3P28472 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GABRB3P28472 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GABRB3P28472 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GABRB3P28472 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GABRB3P28472 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GABRB3P28472 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GABRB3P28472 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GABRB3P28472 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GABRB3P28472 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GABRB3P28472 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GABRB3P28472 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GABRB3P28472 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GABRB3P28472 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GABRB3P28472 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GABRB3P28472 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GABRB3P28472 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms