Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
POLD1P28340 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
POLD1P28340 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
POLD1P28340 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
POLD1P28340 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
POLD1P28340 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
POLD1P28340 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
POLD1P28340 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
POLD1P28340 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
POLD1P28340 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
POLD1P28340 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
POLD1P28340 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
POLD1P28340 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
POLD1P28340 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
POLD1P28340 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
POLD1P28340 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
POLD1P28340 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
POLD1P28340 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
POLD1P28340 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
POLD1P28340 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
POLD1P28340 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
POLD1P28340 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
POLD1P28340 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
POLD1P28340 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
POLD1P28340 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
POLD1P28340 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
POLD1P28340 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
POLD1P28340 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
POLD1P28340 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
POLD1P28340 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
POLD1P28340 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
POLD1P28340 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
POLD1P28340 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
POLD1P28340 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
POLD1P28340 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
POLD1P28340 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
POLD1P28340 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
POLD1P28340 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
POLD1P28340 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
POLD1P28340 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
POLD1P28340 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
POLD1P28340 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
POLD1P28340 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
POLD1P28340 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
POLD1P28340 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
POLD1P28340 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
POLD1P28340 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
POLD1P28340 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
POLD1P28340 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
POLD1P28340 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
POLD1P28340 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
POLD1P28340 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
POLD1P28340 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
POLD1P28340 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
POLD1P28340 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
POLD1P28340 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
POLD1P28340 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
POLD1P28340 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
POLD1P28340 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
POLD1P28340 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
POLD1P28340 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
POLD1P28340 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
POLD1P28340 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
POLD1P28340 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
POLD1P28340 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
POLD1P28340 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
POLD1P28340 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
POLD1P28340 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
POLD1P28340 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
POLD1P28340 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
POLD1P28340 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
POLD1P28340 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
POLD1P28340 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
POLD1P28340 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
POLD1P28340 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
POLD1P28340 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
POLD1P28340 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
POLD1P28340 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
POLD1P28340 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
POLD1P28340 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
POLD1P28340 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
POLD1P28340 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
POLD1P28340 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
POLD1P28340 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
POLD1P28340 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
POLD1P28340 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
POLD1P28340 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
POLD1P28340 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
POLD1P28340 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
POLD1P28340 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
POLD1P28340 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
POLD1P28340 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
POLD1P28340 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
POLD1P28340 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
POLD1P28340 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
POLD1P28340 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
POLD1P28340 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
POLD1P28340 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
POLD1P28340 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
POLD1P28340 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms