Protein–RNA interactions for Protein: P26441

CNTF, Ciliary neurotrophic factor, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFP26441 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTFP26441 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTFP26441 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTFP26441 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTFP26441 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTFP26441 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTFP26441 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTFP26441 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTFP26441 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTFP26441 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTFP26441 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTFP26441 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTFP26441 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTFP26441 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTFP26441 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTFP26441 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTFP26441 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTFP26441 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTFP26441 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTFP26441 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTFP26441 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTFP26441 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTFP26441 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CNTFP26441 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CNTFP26441 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CNTFP26441 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CNTFP26441 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTFP26441 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTFP26441 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTFP26441 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTFP26441 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTFP26441 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTFP26441 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTFP26441 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTFP26441 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTFP26441 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTFP26441 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTFP26441 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTFP26441 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTFP26441 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTFP26441 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTFP26441 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CNTFP26441 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNTFP26441 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CNTFP26441 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNTFP26441 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNTFP26441 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CNTFP26441 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNTFP26441 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNTFP26441 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CNTFP26441 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CNTFP26441 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNTFP26441 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CNTFP26441 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNTFP26441 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTFP26441 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTFP26441 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTFP26441 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTFP26441 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTFP26441 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTFP26441 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTFP26441 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTFP26441 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTFP26441 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTFP26441 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTFP26441 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTFP26441 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTFP26441 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTFP26441 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTFP26441 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTFP26441 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTFP26441 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTFP26441 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTFP26441 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTFP26441 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTFP26441 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTFP26441 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTFP26441 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTFP26441 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTFP26441 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTFP26441 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTFP26441 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTFP26441 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTFP26441 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTFP26441 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTFP26441 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTFP26441 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTFP26441 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTFP26441 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTFP26441 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTFP26441 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNTFP26441 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTFP26441 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTFP26441 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTFP26441 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTFP26441 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTFP26441 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTFP26441 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTFP26441 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNTFP26441 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms