Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLR2AP24928 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLR2AP24928 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLR2AP24928 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLR2AP24928 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLR2AP24928 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLR2AP24928 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
POLR2AP24928 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLR2AP24928 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLR2AP24928 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLR2AP24928 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
POLR2AP24928 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLR2AP24928 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLR2AP24928 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLR2AP24928 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLR2AP24928 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLR2AP24928 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLR2AP24928 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLR2AP24928 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLR2AP24928 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLR2AP24928 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLR2AP24928 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLR2AP24928 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
POLR2AP24928 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
POLR2AP24928 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
POLR2AP24928 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
POLR2AP24928 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
POLR2AP24928 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
POLR2AP24928 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
POLR2AP24928 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
POLR2AP24928 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
POLR2AP24928 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
POLR2AP24928 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
POLR2AP24928 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
POLR2AP24928 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
POLR2AP24928 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
POLR2AP24928 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
POLR2AP24928 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
POLR2AP24928 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
POLR2AP24928 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
POLR2AP24928 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
POLR2AP24928 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
POLR2AP24928 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
POLR2AP24928 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
POLR2AP24928 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
POLR2AP24928 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
POLR2AP24928 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
POLR2AP24928 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
POLR2AP24928 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
POLR2AP24928 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
POLR2AP24928 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
POLR2AP24928 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
POLR2AP24928 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
POLR2AP24928 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
POLR2AP24928 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
POLR2AP24928 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.8
POLR2AP24928 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
POLR2AP24928 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.8
POLR2AP24928 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLR2AP24928 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
POLR2AP24928 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLR2AP24928 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLR2AP24928 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLR2AP24928 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLR2AP24928 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLR2AP24928 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLR2AP24928 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLR2AP24928 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLR2AP24928 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLR2AP24928 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLR2AP24928 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLR2AP24928 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLR2AP24928 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLR2AP24928 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLR2AP24928 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLR2AP24928 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLR2AP24928 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLR2AP24928 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLR2AP24928 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLR2AP24928 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLR2AP24928 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLR2AP24928 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLR2AP24928 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLR2AP24928 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLR2AP24928 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLR2AP24928 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLR2AP24928 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLR2AP24928 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR2AP24928 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR2AP24928 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR2AP24928 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR2AP24928 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR2AP24928 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR2AP24928 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLR2AP24928 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLR2AP24928 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLR2AP24928 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLR2AP24928 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
POLR2AP24928 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
POLR2AP24928 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms