Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCP2P22307 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCP2P22307 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCP2P22307 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCP2P22307 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCP2P22307 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCP2P22307 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCP2P22307 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCP2P22307 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCP2P22307 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCP2P22307 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCP2P22307 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCP2P22307 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCP2P22307 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCP2P22307 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCP2P22307 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCP2P22307 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCP2P22307 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCP2P22307 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCP2P22307 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCP2P22307 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCP2P22307 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCP2P22307 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCP2P22307 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCP2P22307 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCP2P22307 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCP2P22307 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCP2P22307 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SCP2P22307 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCP2P22307 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCP2P22307 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCP2P22307 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCP2P22307 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCP2P22307 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCP2P22307 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCP2P22307 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCP2P22307 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCP2P22307 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SCP2P22307 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCP2P22307 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCP2P22307 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCP2P22307 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SCP2P22307 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCP2P22307 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCP2P22307 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCP2P22307 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCP2P22307 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCP2P22307 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SCP2P22307 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCP2P22307 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCP2P22307 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCP2P22307 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCP2P22307 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCP2P22307 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCP2P22307 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCP2P22307 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCP2P22307 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCP2P22307 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCP2P22307 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCP2P22307 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCP2P22307 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCP2P22307 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCP2P22307 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCP2P22307 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCP2P22307 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCP2P22307 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCP2P22307 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SCP2P22307 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SCP2P22307 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCP2P22307 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCP2P22307 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCP2P22307 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCP2P22307 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCP2P22307 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCP2P22307 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCP2P22307 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCP2P22307 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCP2P22307 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SCP2P22307 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCP2P22307 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SCP2P22307 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SCP2P22307 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCP2P22307 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCP2P22307 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCP2P22307 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SCP2P22307 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCP2P22307 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCP2P22307 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCP2P22307 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCP2P22307 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCP2P22307 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SCP2P22307 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCP2P22307 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCP2P22307 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SCP2P22307 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCP2P22307 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SCP2P22307 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCP2P22307 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCP2P22307 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCP2P22307 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms