Protein–RNA interactions for Protein: P20941

PDC, Phosducin, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCP20941 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDCP20941 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDCP20941 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDCP20941 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDCP20941 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDCP20941 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDCP20941 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDCP20941 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDCP20941 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDCP20941 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDCP20941 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDCP20941 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDCP20941 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDCP20941 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDCP20941 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDCP20941 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDCP20941 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDCP20941 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDCP20941 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDCP20941 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDCP20941 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDCP20941 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDCP20941 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDCP20941 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDCP20941 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDCP20941 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDCP20941 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDCP20941 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDCP20941 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDCP20941 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDCP20941 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDCP20941 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDCP20941 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDCP20941 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDCP20941 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDCP20941 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDCP20941 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDCP20941 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDCP20941 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDCP20941 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PDCP20941 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDCP20941 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDCP20941 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDCP20941 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDCP20941 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDCP20941 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDCP20941 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDCP20941 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PDCP20941 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDCP20941 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PDCP20941 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PDCP20941 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PDCP20941 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PDCP20941 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PDCP20941 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
PDCP20941 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDCP20941 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDCP20941 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PDCP20941 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDCP20941 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDCP20941 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDCP20941 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDCP20941 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDCP20941 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDCP20941 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDCP20941 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDCP20941 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDCP20941 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDCP20941 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDCP20941 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDCP20941 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDCP20941 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDCP20941 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDCP20941 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDCP20941 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDCP20941 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDCP20941 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDCP20941 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PDCP20941 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDCP20941 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDCP20941 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PDCP20941 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDCP20941 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDCP20941 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDCP20941 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDCP20941 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDCP20941 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDCP20941 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDCP20941 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDCP20941 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDCP20941 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDCP20941 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDCP20941 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDCP20941 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDCP20941 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDCP20941 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDCP20941 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDCP20941 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDCP20941 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDCP20941 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms