Protein–RNA interactions for Protein: P19113

HDC, Histidine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 662 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDCP19113 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDCP19113 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDCP19113 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDCP19113 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDCP19113 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDCP19113 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDCP19113 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDCP19113 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDCP19113 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDCP19113 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDCP19113 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDCP19113 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDCP19113 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDCP19113 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDCP19113 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDCP19113 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDCP19113 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDCP19113 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDCP19113 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDCP19113 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDCP19113 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDCP19113 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDCP19113 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDCP19113 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDCP19113 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDCP19113 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HDCP19113 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HDCP19113 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDCP19113 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDCP19113 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDCP19113 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDCP19113 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDCP19113 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDCP19113 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HDCP19113 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDCP19113 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDCP19113 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDCP19113 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDCP19113 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDCP19113 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDCP19113 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDCP19113 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HDCP19113 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDCP19113 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDCP19113 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDCP19113 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDCP19113 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HDCP19113 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HDCP19113 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HDCP19113 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HDCP19113 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDCP19113 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDCP19113 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HDCP19113 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
HDCP19113 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HDCP19113 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDCP19113 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
HDCP19113 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDCP19113 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HDCP19113 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HDCP19113 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDCP19113 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDCP19113 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDCP19113 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDCP19113 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDCP19113 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDCP19113 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDCP19113 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HDCP19113 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDCP19113 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HDCP19113 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDCP19113 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDCP19113 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDCP19113 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDCP19113 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDCP19113 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDCP19113 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDCP19113 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDCP19113 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDCP19113 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDCP19113 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDCP19113 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDCP19113 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDCP19113 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDCP19113 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDCP19113 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDCP19113 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDCP19113 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDCP19113 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDCP19113 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDCP19113 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDCP19113 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDCP19113 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HDCP19113 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDCP19113 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDCP19113 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDCP19113 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDCP19113 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDCP19113 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDCP19113 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms