Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACTN1P12814 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACTN1P12814 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ACTN1P12814 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACTN1P12814 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACTN1P12814 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACTN1P12814 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACTN1P12814 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACTN1P12814 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACTN1P12814 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACTN1P12814 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACTN1P12814 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACTN1P12814 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACTN1P12814 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACTN1P12814 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACTN1P12814 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACTN1P12814 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACTN1P12814 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACTN1P12814 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ACTN1P12814 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACTN1P12814 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACTN1P12814 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACTN1P12814 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ACTN1P12814 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACTN1P12814 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACTN1P12814 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACTN1P12814 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACTN1P12814 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACTN1P12814 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACTN1P12814 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACTN1P12814 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACTN1P12814 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACTN1P12814 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACTN1P12814 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACTN1P12814 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACTN1P12814 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACTN1P12814 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACTN1P12814 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACTN1P12814 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACTN1P12814 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACTN1P12814 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACTN1P12814 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACTN1P12814 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ACTN1P12814 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ACTN1P12814 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ACTN1P12814 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ACTN1P12814 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ACTN1P12814 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ACTN1P12814 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACTN1P12814 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACTN1P12814 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ACTN1P12814 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACTN1P12814 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACTN1P12814 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ACTN1P12814 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ACTN1P12814 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACTN1P12814 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACTN1P12814 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACTN1P12814 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACTN1P12814 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACTN1P12814 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACTN1P12814 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACTN1P12814 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACTN1P12814 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACTN1P12814 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACTN1P12814 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ACTN1P12814 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACTN1P12814 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACTN1P12814 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACTN1P12814 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACTN1P12814 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACTN1P12814 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACTN1P12814 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACTN1P12814 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACTN1P12814 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACTN1P12814 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACTN1P12814 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACTN1P12814 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACTN1P12814 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ACTN1P12814 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACTN1P12814 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACTN1P12814 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ACTN1P12814 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACTN1P12814 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACTN1P12814 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACTN1P12814 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACTN1P12814 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACTN1P12814 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACTN1P12814 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACTN1P12814 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACTN1P12814 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACTN1P12814 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACTN1P12814 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACTN1P12814 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACTN1P12814 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACTN1P12814 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACTN1P12814 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACTN1P12814 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ACTN1P12814 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACTN1P12814 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms