Protein–RNA interactions for Protein: P09067

HOXB5, Homeobox protein Hox-B5, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB5P09067 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXB5P09067 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXB5P09067 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXB5P09067 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXB5P09067 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXB5P09067 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXB5P09067 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXB5P09067 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXB5P09067 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXB5P09067 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXB5P09067 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXB5P09067 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXB5P09067 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXB5P09067 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXB5P09067 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXB5P09067 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXB5P09067 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXB5P09067 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXB5P09067 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXB5P09067 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXB5P09067 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXB5P09067 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXB5P09067 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXB5P09067 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXB5P09067 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXB5P09067 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXB5P09067 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXB5P09067 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXB5P09067 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXB5P09067 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXB5P09067 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXB5P09067 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXB5P09067 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXB5P09067 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXB5P09067 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXB5P09067 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXB5P09067 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXB5P09067 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXB5P09067 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXB5P09067 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXB5P09067 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXB5P09067 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXB5P09067 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXB5P09067 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXB5P09067 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXB5P09067 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXB5P09067 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXB5P09067 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXB5P09067 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXB5P09067 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXB5P09067 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXB5P09067 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXB5P09067 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXB5P09067 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXB5P09067 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXB5P09067 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXB5P09067 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXB5P09067 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXB5P09067 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXB5P09067 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXB5P09067 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXB5P09067 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXB5P09067 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXB5P09067 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXB5P09067 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXB5P09067 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXB5P09067 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXB5P09067 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXB5P09067 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXB5P09067 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXB5P09067 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXB5P09067 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXB5P09067 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXB5P09067 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXB5P09067 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXB5P09067 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXB5P09067 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXB5P09067 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXB5P09067 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXB5P09067 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXB5P09067 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXB5P09067 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXB5P09067 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXB5P09067 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB5P09067 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB5P09067 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB5P09067 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB5P09067 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB5P09067 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB5P09067 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB5P09067 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB5P09067 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB5P09067 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB5P09067 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB5P09067 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB5P09067 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB5P09067 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB5P09067 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB5P09067 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB5P09067 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms