Protein–RNA interactions for Protein: O43752

STX6, Syntaxin-6, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX6O43752 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
STX6O43752 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
STX6O43752 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
STX6O43752 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
STX6O43752 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
STX6O43752 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
STX6O43752 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
STX6O43752 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
STX6O43752 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
STX6O43752 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
STX6O43752 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
STX6O43752 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
STX6O43752 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
STX6O43752 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
STX6O43752 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
STX6O43752 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
STX6O43752 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
STX6O43752 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
STX6O43752 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
STX6O43752 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
STX6O43752 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
STX6O43752 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
STX6O43752 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
STX6O43752 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
STX6O43752 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
STX6O43752 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
STX6O43752 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
STX6O43752 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
STX6O43752 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
STX6O43752 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
STX6O43752 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
STX6O43752 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
STX6O43752 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
STX6O43752 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
STX6O43752 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
STX6O43752 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
STX6O43752 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
STX6O43752 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
STX6O43752 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
STX6O43752 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
STX6O43752 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
STX6O43752 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
STX6O43752 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
STX6O43752 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
STX6O43752 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
STX6O43752 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
STX6O43752 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
STX6O43752 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
STX6O43752 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
STX6O43752 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
STX6O43752 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
STX6O43752 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
STX6O43752 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
STX6O43752 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
STX6O43752 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
STX6O43752 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
STX6O43752 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
STX6O43752 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
STX6O43752 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
STX6O43752 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
STX6O43752 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
STX6O43752 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
STX6O43752 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
STX6O43752 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
STX6O43752 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
STX6O43752 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
STX6O43752 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
STX6O43752 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
STX6O43752 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
STX6O43752 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
STX6O43752 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
STX6O43752 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
STX6O43752 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
STX6O43752 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
STX6O43752 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
STX6O43752 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
STX6O43752 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
STX6O43752 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
STX6O43752 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
STX6O43752 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
STX6O43752 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
STX6O43752 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
STX6O43752 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
STX6O43752 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
STX6O43752 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
STX6O43752 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
STX6O43752 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
STX6O43752 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
STX6O43752 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
STX6O43752 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
STX6O43752 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
STX6O43752 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
STX6O43752 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
STX6O43752 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
STX6O43752 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
STX6O43752 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
STX6O43752 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
STX6O43752 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
STX6O43752 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
STX6O43752 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms