Protein–RNA interactions for Protein: H7C0C1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C0C1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H7C0C1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
H7C0C1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
H7C0C1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
H7C0C1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
H7C0C1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
H7C0C1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
H7C0C1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
H7C0C1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
H7C0C1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H7C0C1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
H7C0C1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H7C0C1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
H7C0C1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
H7C0C1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H7C0C1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
H7C0C1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H7C0C1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H7C0C1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
H7C0C1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
H7C0C1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
H7C0C1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
H7C0C1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H7C0C1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H7C0C1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H7C0C1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H7C0C1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H7C0C1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
H7C0C1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
H7C0C1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H7C0C1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H7C0C1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
H7C0C1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H7C0C1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H7C0C1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H7C0C1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H7C0C1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H7C0C1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H7C0C1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H7C0C1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
H7C0C1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
H7C0C1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
H7C0C1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H7C0C1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H7C0C1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
H7C0C1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H7C0C1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H7C0C1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H7C0C1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H7C0C1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H7C0C1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H7C0C1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H7C0C1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
H7C0C1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
H7C0C1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
H7C0C1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
H7C0C1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H7C0C1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
H7C0C1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H7C0C1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
H7C0C1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
H7C0C1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H7C0C1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H7C0C1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
H7C0C1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
H7C0C1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H7C0C1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H7C0C1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
H7C0C1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
H7C0C1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
H7C0C1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H7C0C1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
H7C0C1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
H7C0C1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H7C0C1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
H7C0C1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H7C0C1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
H7C0C1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
H7C0C1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H7C0C1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H7C0C1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
H7C0C1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
H7C0C1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
H7C0C1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
H7C0C1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H7C0C1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H7C0C1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H7C0C1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H7C0C1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
H7C0C1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H7C0C1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H7C0C1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H7C0C1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
H7C0C1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
H7C0C1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H7C0C1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H7C0C1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
H7C0C1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H7C0C1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H7C0C1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms