Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
IRGMA1A4Y4 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
IRGMA1A4Y4 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
IRGMA1A4Y4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
IRGMA1A4Y4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
IRGMA1A4Y4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
IRGMA1A4Y4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
IRGMA1A4Y4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
IRGMA1A4Y4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
IRGMA1A4Y4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
IRGMA1A4Y4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
IRGMA1A4Y4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
IRGMA1A4Y4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
IRGMA1A4Y4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
IRGMA1A4Y4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
IRGMA1A4Y4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
IRGMA1A4Y4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
IRGMA1A4Y4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
IRGMA1A4Y4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
IRGMA1A4Y4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
IRGMA1A4Y4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
IRGMA1A4Y4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
IRGMA1A4Y4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
IRGMA1A4Y4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
IRGMA1A4Y4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
IRGMA1A4Y4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
IRGMA1A4Y4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
IRGMA1A4Y4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
IRGMA1A4Y4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
IRGMA1A4Y4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
IRGMA1A4Y4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
IRGMA1A4Y4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
IRGMA1A4Y4 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
IRGMA1A4Y4 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
IRGMA1A4Y4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
IRGMA1A4Y4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
IRGMA1A4Y4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
IRGMA1A4Y4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
IRGMA1A4Y4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
IRGMA1A4Y4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
IRGMA1A4Y4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
IRGMA1A4Y4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
IRGMA1A4Y4 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
IRGMA1A4Y4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
IRGMA1A4Y4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
IRGMA1A4Y4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
IRGMA1A4Y4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
IRGMA1A4Y4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
IRGMA1A4Y4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
IRGMA1A4Y4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
IRGMA1A4Y4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
IRGMA1A4Y4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
IRGMA1A4Y4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
IRGMA1A4Y4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
IRGMA1A4Y4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
IRGMA1A4Y4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
IRGMA1A4Y4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
IRGMA1A4Y4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
IRGMA1A4Y4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
IRGMA1A4Y4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
IRGMA1A4Y4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
IRGMA1A4Y4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
IRGMA1A4Y4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
IRGMA1A4Y4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.77■□□□□ 0.75
IRGMA1A4Y4 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
IRGMA1A4Y4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
IRGMA1A4Y4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
IRGMA1A4Y4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
IRGMA1A4Y4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
IRGMA1A4Y4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
IRGMA1A4Y4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
IRGMA1A4Y4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
IRGMA1A4Y4 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
IRGMA1A4Y4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
IRGMA1A4Y4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
IRGMA1A4Y4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
IRGMA1A4Y4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
IRGMA1A4Y4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
IRGMA1A4Y4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
IRGMA1A4Y4 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
IRGMA1A4Y4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
IRGMA1A4Y4 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
IRGMA1A4Y4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
IRGMA1A4Y4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
IRGMA1A4Y4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
IRGMA1A4Y4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
IRGMA1A4Y4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
IRGMA1A4Y4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
IRGMA1A4Y4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
IRGMA1A4Y4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
IRGMA1A4Y4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
IRGMA1A4Y4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
IRGMA1A4Y4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
IRGMA1A4Y4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
IRGMA1A4Y4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
IRGMA1A4Y4 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
IRGMA1A4Y4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
IRGMA1A4Y4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
IRGMA1A4Y4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
IRGMA1A4Y4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms