Protein–RNA interactions for Protein: A8MYP8

ODF3B, Outer dense fiber protein 3B, humanhuman

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Length 253 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3BA8MYP8 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 MED27-201ENST00000292035 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 RSPO2-202ENST00000517781 2748 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 SEPT10-208ENST00000437928 1782 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 STK24-201ENST00000376547 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 ZNF215-207ENST00000610573 1503 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 PRPF38A-201ENST00000257181 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 SLC2A14-213ENST00000539924 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 KLF4-206ENST00000610832 1956 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 TRPM3-205ENST00000361823 1260 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 ASLP1-201ENST00000428790 637 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 RPL15-208ENST00000435882 1063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 AL137078.1-201ENST00000446280 404 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 VPS33A-202ENST00000451053 1154 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 PILRA-205ENST00000453419 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 BACE1-207ENST00000510630 1236 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 CHCHD10-204ENST00000520222 384 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 IGLVI-63-201ENST00000524184 384 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 AP001360.1-203ENST00000524708 464 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 AP001102.1-201ENST00000528959 409 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 TMEM241-208ENST00000542162 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 AC011603.2-201ENST00000548149 675 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 TSHZ3-202ENST00000558569 441 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 AC090971.1-201ENST00000559302 510 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 RBMX-209ENST00000565438 1292 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 AC007610.1-201ENST00000568130 498 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 USE1-207ENST00000596136 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 PRR20FP-201ENST00000603320 180 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 OR5L1-201ENST00000625203 1110 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 AL590094.1-206ENST00000635959 478 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 AL590094.1-209ENST00000637260 499 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 CYYR1-201ENST00000299340 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 TMEM74B-201ENST00000381894 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 TRMT2B-202ENST00000372936 3327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 GLYR1-212ENST00000591451 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 RBMY1E-203ENST00000382659 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 RBMY1D-202ENST00000382680 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 RBMY1A1-203ENST00000382707 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 RBMY1B-202ENST00000383020 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 TMEM26-202ENST00000399298 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 TMUB2-214ENST00000590235 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 MAGED2-205ENST00000375060 1798 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 MAGEA11-202ENST00000355220 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 IKZF1-203ENST00000346667 5376 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 ACR-201ENST00000216139 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 RNF34-203ENST00000392465 2051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 ZNF185-205ENST00000370270 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 FHL2-208ENST00000409807 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 ZNF555-203ENST00000591539 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 C16orf62-215ENST00000542263 3138 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 ATG7-213ENST00000446450 2042 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 FAM76A-202ENST00000234549 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 ZCCHC7-201ENST00000322831 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 SNORA30.1-201ENST00000363193 129 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 PITHD1-202ENST00000374524 1292 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 AC105443.1-201ENST00000433754 712 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 KRT19P4-201ENST00000443208 943 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 P2RX6P-202ENST00000450626 357 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 PSME2P2-201ENST00000453033 700 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 WNT5A-205ENST00000497027 1299 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 HNRNPA1P55-201ENST00000505935 955 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 AC233724.9-201ENST00000511694 407 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 AC022424.2-201ENST00000514848 454 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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