Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RPS29P62273 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
RPS29P62273 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
RPS29P62273 MEFV-209ENST00000541159 1888 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
RPS29P62273 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
RPS29P62273 ZP4-201ENST00000366570 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
RPS29P62273 FAM238C-202ENST00000639963 1787 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RPS29P62273 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
RPS29P62273 CDC20-201ENST00000310955 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
RPS29P62273 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
RPS29P62273 TMEM131L-203ENST00000409959 5017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RPS29P62273 XYLB-203ENST00000427323 1666 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RPS29P62273 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
RPS29P62273 DGKE-201ENST00000284061 8660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
RPS29P62273 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RPS29P62273 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RPS29P62273 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RPS29P62273 CES1-201ENST00000360526 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
RPS29P62273 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
RPS29P62273 SLC6A9-205ENST00000372310 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RPS29P62273 SLC26A8-202ENST00000394602 3144 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
RPS29P62273 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
RPS29P62273 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
RPS29P62273 ABCB7-203ENST00000373394 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
RPS29P62273 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
RPS29P62273 MYL3-201ENST00000292327 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
RPS29P62273 MYL1-202ENST00000352451 1065 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
RPS29P62273 MRPL18-201ENST00000367034 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
RPS29P62273 LY6G6F-201ENST00000375832 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
RPS29P62273 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
RPS29P62273 AL158207.2-201ENST00000414926 266 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RPS29P62273 IGHV3-74-201ENST00000424969 587 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RPS29P62273 AL158847.1-201ENST00000431955 808 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RPS29P62273 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RPS29P62273 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RPS29P62273 AC104623.1-201ENST00000446357 546 ntTSL 4 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RPS29P62273 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
RPS29P62273 AADAC-202ENST00000488869 719 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RPS29P62273 AC139795.1-201ENST00000499314 838 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RPS29P62273 BACE1-207ENST00000510630 1236 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RPS29P62273 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RPS29P62273 AP001360.1-203ENST00000524708 464 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RPS29P62273 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RPS29P62273 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RPS29P62273 CMTM1-219ENST00000533953 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
RPS29P62273 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RPS29P62273 AC145422.1-201ENST00000541574 544 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RPS29P62273 TMEM241-208ENST00000542162 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
RPS29P62273 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
RPS29P62273 AC004801.1-201ENST00000549557 360 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
RPS29P62273 MIR4763-201ENST00000581461 92 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
RPS29P62273 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
RPS29P62273 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
RPS29P62273 AC011495.2-201ENST00000600665 360 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RPS29P62273 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RPS29P62273 OR2A25-203ENST00000641663 1741 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RPS29P62273 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
RPS29P62273 EFHC1-224ENST00000636702 2197 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RPS29P62273 NLRC3-202ENST00000359128 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
RPS29P62273 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RPS29P62273 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
RPS29P62273 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
RPS29P62273 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
RPS29P62273 DCAF5-209ENST00000557386 2883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
RPS29P62273 CDC25C-202ENST00000348983 1951 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RPS29P62273 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RPS29P62273 AL133464.1-205ENST00000634595 1535 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RPS29P62273 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RPS29P62273 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RPS29P62273 LINC01679-201ENST00000442815 2798 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RPS29P62273 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
RPS29P62273 UBE2W-201ENST00000419880 2315 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
RPS29P62273 IL1R2-202ENST00000393414 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
RPS29P62273 AC099786.2-201ENST00000427892 2203 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RPS29P62273 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
RPS29P62273 SMUG1-220ENST00000513838 2119 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
RPS29P62273 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
RPS29P62273 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
RPS29P62273 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RPS29P62273 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
RPS29P62273 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
RPS29P62273 SNU13-203ENST00000401959 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
RPS29P62273 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
RPS29P62273 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
RPS29P62273 CTCFL-211ENST00000502686 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
RPS29P62273 ESRRB-201ENST00000380887 2745 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RPS29P62273 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RPS29P62273 MAT2B-204ENST00000518095 3409 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
RPS29P62273 SQSTM1-201ENST00000360718 2253 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
RPS29P62273 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
RPS29P62273 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RPS29P62273 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RPS29P62273 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RPS29P62273 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
RPS29P62273 TMEM101-205ENST00000589334 1830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RPS29P62273 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
RPS29P62273 ST3GAL3-202ENST00000330208 1479 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RPS29P62273 ANAPC15-203ENST00000502597 1481 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
RPS29P62273 AC025538.1-201ENST00000510707 1486 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
RPS29P62273 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms