Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 EFL1-201ENST00000268206 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 G2E3-212ENST00000553504 3796 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 PTPN11-205ENST00000635625 1794 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 GPATCH2L-202ENST00000312858 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 ALAS1-202ENST00000394965 2430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 IRF5-213ENST00000489702 2988 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 TLE3-222ENST00000560589 3509 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 COL20A1-201ENST00000358894 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 SYNM-203ENST00000560674 5908 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 RAB5A-203ENST00000422242 1443 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 TPRX1-203ENST00000543508 1526 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 ITSN1-207ENST00000399338 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 FAM156A-223ENST00000623782 1931 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 CACNA1F-203ENST00000376265 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 SH3PXD2A-203ENST00000369774 11468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 IL21R-202ENST00000395754 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 CNN2-207ENST00000565096 2109 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 PLEKHM1-201ENST00000430334 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 GRAMD1B-202ENST00000450171 2431 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 OR10G3-202ENST00000641040 2533 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 PCID2-206ENST00000375479 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 GOLGA3-201ENST00000204726 9252 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 FAM160A1-201ENST00000435205 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 RAP1GAP-205ENST00000374763 3334 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 AC026904.1-201ENST00000430626 3549 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 DGCR8-203ENST00000407755 4129 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 F7-206ENST00000541084 2873 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 PTOV1-AS1-202ENST00000600742 3181 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 ESRP2-210ENST00000565858 3386 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 TJP2-201ENST00000348208 4058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 SLC2A5-202ENST00000377424 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 FUT10-211ENST00000524021 2042 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 SART3-202ENST00000431469 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 DIS3L2-201ENST00000273009 3201 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 ABCD1-201ENST00000218104 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 SRD5A1-201ENST00000274192 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 GBA-201ENST00000327247 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 GRB10-210ENST00000407526 2279 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 SDCBP2-AS1-204ENST00000609470 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 DANT2-201ENST00000430756 2079 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 AHSG-201ENST00000273784 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 PROZ-201ENST00000342783 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 ATP6V0D1-218ENST00000602876 1554 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
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