Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PAXBP1Q9Y5B6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PAXBP1Q9Y5B6 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PAXBP1Q9Y5B6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PAXBP1Q9Y5B6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PAXBP1Q9Y5B6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PAXBP1Q9Y5B6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PAXBP1Q9Y5B6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PAXBP1Q9Y5B6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PAXBP1Q9Y5B6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PAXBP1Q9Y5B6 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PAXBP1Q9Y5B6 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PAXBP1Q9Y5B6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PAXBP1Q9Y5B6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PAXBP1Q9Y5B6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PAXBP1Q9Y5B6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PAXBP1Q9Y5B6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PAXBP1Q9Y5B6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PAXBP1Q9Y5B6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PAXBP1Q9Y5B6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PAXBP1Q9Y5B6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PAXBP1Q9Y5B6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PAXBP1Q9Y5B6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PAXBP1Q9Y5B6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PAXBP1Q9Y5B6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PAXBP1Q9Y5B6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PAXBP1Q9Y5B6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PAXBP1Q9Y5B6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PAXBP1Q9Y5B6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PAXBP1Q9Y5B6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PAXBP1Q9Y5B6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PAXBP1Q9Y5B6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PAXBP1Q9Y5B6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PAXBP1Q9Y5B6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PAXBP1Q9Y5B6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PAXBP1Q9Y5B6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PAXBP1Q9Y5B6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PAXBP1Q9Y5B6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PAXBP1Q9Y5B6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PAXBP1Q9Y5B6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PAXBP1Q9Y5B6 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PAXBP1Q9Y5B6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PAXBP1Q9Y5B6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PAXBP1Q9Y5B6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PAXBP1Q9Y5B6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PAXBP1Q9Y5B6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PAXBP1Q9Y5B6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PAXBP1Q9Y5B6 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PAXBP1Q9Y5B6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PAXBP1Q9Y5B6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PAXBP1Q9Y5B6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PAXBP1Q9Y5B6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PAXBP1Q9Y5B6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PAXBP1Q9Y5B6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PAXBP1Q9Y5B6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PAXBP1Q9Y5B6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PAXBP1Q9Y5B6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PAXBP1Q9Y5B6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PAXBP1Q9Y5B6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PAXBP1Q9Y5B6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PAXBP1Q9Y5B6 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PAXBP1Q9Y5B6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAXBP1Q9Y5B6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PAXBP1Q9Y5B6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAXBP1Q9Y5B6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAXBP1Q9Y5B6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAXBP1Q9Y5B6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAXBP1Q9Y5B6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAXBP1Q9Y5B6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAXBP1Q9Y5B6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAXBP1Q9Y5B6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAXBP1Q9Y5B6 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAXBP1Q9Y5B6 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAXBP1Q9Y5B6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAXBP1Q9Y5B6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PAXBP1Q9Y5B6 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAXBP1Q9Y5B6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAXBP1Q9Y5B6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAXBP1Q9Y5B6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAXBP1Q9Y5B6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAXBP1Q9Y5B6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAXBP1Q9Y5B6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAXBP1Q9Y5B6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAXBP1Q9Y5B6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAXBP1Q9Y5B6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAXBP1Q9Y5B6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAXBP1Q9Y5B6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAXBP1Q9Y5B6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAXBP1Q9Y5B6 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAXBP1Q9Y5B6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAXBP1Q9Y5B6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAXBP1Q9Y5B6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAXBP1Q9Y5B6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAXBP1Q9Y5B6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAXBP1Q9Y5B6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAXBP1Q9Y5B6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAXBP1Q9Y5B6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAXBP1Q9Y5B6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAXBP1Q9Y5B6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms