Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GGA1Q9UJY5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GGA1Q9UJY5 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GGA1Q9UJY5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GGA1Q9UJY5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GGA1Q9UJY5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GGA1Q9UJY5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GGA1Q9UJY5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GGA1Q9UJY5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GGA1Q9UJY5 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GGA1Q9UJY5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GGA1Q9UJY5 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GGA1Q9UJY5 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GGA1Q9UJY5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GGA1Q9UJY5 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GGA1Q9UJY5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GGA1Q9UJY5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GGA1Q9UJY5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GGA1Q9UJY5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GGA1Q9UJY5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
GGA1Q9UJY5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GGA1Q9UJY5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GGA1Q9UJY5 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GGA1Q9UJY5 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GGA1Q9UJY5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GGA1Q9UJY5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GGA1Q9UJY5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GGA1Q9UJY5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GGA1Q9UJY5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GGA1Q9UJY5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GGA1Q9UJY5 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GGA1Q9UJY5 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GGA1Q9UJY5 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GGA1Q9UJY5 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GGA1Q9UJY5 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GGA1Q9UJY5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GGA1Q9UJY5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GGA1Q9UJY5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GGA1Q9UJY5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GGA1Q9UJY5 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GGA1Q9UJY5 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GGA1Q9UJY5 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GGA1Q9UJY5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GGA1Q9UJY5 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GGA1Q9UJY5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GGA1Q9UJY5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GGA1Q9UJY5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GGA1Q9UJY5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GGA1Q9UJY5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GGA1Q9UJY5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GGA1Q9UJY5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GGA1Q9UJY5 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GGA1Q9UJY5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GGA1Q9UJY5 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GGA1Q9UJY5 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GGA1Q9UJY5 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GGA1Q9UJY5 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GGA1Q9UJY5 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GGA1Q9UJY5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GGA1Q9UJY5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GGA1Q9UJY5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GGA1Q9UJY5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GGA1Q9UJY5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GGA1Q9UJY5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GGA1Q9UJY5 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GGA1Q9UJY5 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GGA1Q9UJY5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GGA1Q9UJY5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GGA1Q9UJY5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GGA1Q9UJY5 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GGA1Q9UJY5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GGA1Q9UJY5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GGA1Q9UJY5 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GGA1Q9UJY5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GGA1Q9UJY5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GGA1Q9UJY5 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GGA1Q9UJY5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GGA1Q9UJY5 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GGA1Q9UJY5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GGA1Q9UJY5 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GGA1Q9UJY5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GGA1Q9UJY5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GGA1Q9UJY5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GGA1Q9UJY5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GGA1Q9UJY5 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GGA1Q9UJY5 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GGA1Q9UJY5 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GGA1Q9UJY5 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GGA1Q9UJY5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GGA1Q9UJY5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GGA1Q9UJY5 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
GGA1Q9UJY5 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
GGA1Q9UJY5 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GGA1Q9UJY5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GGA1Q9UJY5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GGA1Q9UJY5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
GGA1Q9UJY5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GGA1Q9UJY5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GGA1Q9UJY5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
GGA1Q9UJY5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms