Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII4

HERC5, E3 ISG15--protein ligase HERC5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC5Q9UII4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HERC5Q9UII4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HERC5Q9UII4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HERC5Q9UII4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HERC5Q9UII4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HERC5Q9UII4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HERC5Q9UII4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HERC5Q9UII4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HERC5Q9UII4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HERC5Q9UII4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HERC5Q9UII4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HERC5Q9UII4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HERC5Q9UII4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HERC5Q9UII4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HERC5Q9UII4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HERC5Q9UII4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HERC5Q9UII4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HERC5Q9UII4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
HERC5Q9UII4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HERC5Q9UII4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HERC5Q9UII4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HERC5Q9UII4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HERC5Q9UII4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HERC5Q9UII4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HERC5Q9UII4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
HERC5Q9UII4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HERC5Q9UII4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HERC5Q9UII4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HERC5Q9UII4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HERC5Q9UII4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HERC5Q9UII4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HERC5Q9UII4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
HERC5Q9UII4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HERC5Q9UII4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HERC5Q9UII4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HERC5Q9UII4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
HERC5Q9UII4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HERC5Q9UII4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HERC5Q9UII4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HERC5Q9UII4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HERC5Q9UII4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HERC5Q9UII4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HERC5Q9UII4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HERC5Q9UII4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HERC5Q9UII4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HERC5Q9UII4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HERC5Q9UII4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HERC5Q9UII4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HERC5Q9UII4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HERC5Q9UII4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HERC5Q9UII4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HERC5Q9UII4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HERC5Q9UII4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HERC5Q9UII4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HERC5Q9UII4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HERC5Q9UII4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HERC5Q9UII4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HERC5Q9UII4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HERC5Q9UII4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HERC5Q9UII4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HERC5Q9UII4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HERC5Q9UII4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HERC5Q9UII4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HERC5Q9UII4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HERC5Q9UII4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HERC5Q9UII4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HERC5Q9UII4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HERC5Q9UII4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HERC5Q9UII4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HERC5Q9UII4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HERC5Q9UII4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HERC5Q9UII4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HERC5Q9UII4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HERC5Q9UII4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
HERC5Q9UII4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HERC5Q9UII4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HERC5Q9UII4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HERC5Q9UII4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HERC5Q9UII4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HERC5Q9UII4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HERC5Q9UII4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HERC5Q9UII4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HERC5Q9UII4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HERC5Q9UII4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
HERC5Q9UII4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
HERC5Q9UII4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HERC5Q9UII4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HERC5Q9UII4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
HERC5Q9UII4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HERC5Q9UII4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HERC5Q9UII4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
HERC5Q9UII4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HERC5Q9UII4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
HERC5Q9UII4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HERC5Q9UII4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HERC5Q9UII4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HERC5Q9UII4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HERC5Q9UII4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HERC5Q9UII4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HERC5Q9UII4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms