Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF2IRD1Q9UHL9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF2IRD1Q9UHL9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF2IRD1Q9UHL9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF2IRD1Q9UHL9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF2IRD1Q9UHL9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF2IRD1Q9UHL9 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF2IRD1Q9UHL9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF2IRD1Q9UHL9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF2IRD1Q9UHL9 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF2IRD1Q9UHL9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF2IRD1Q9UHL9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF2IRD1Q9UHL9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF2IRD1Q9UHL9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF2IRD1Q9UHL9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF2IRD1Q9UHL9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF2IRD1Q9UHL9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF2IRD1Q9UHL9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF2IRD1Q9UHL9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF2IRD1Q9UHL9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF2IRD1Q9UHL9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF2IRD1Q9UHL9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF2IRD1Q9UHL9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF2IRD1Q9UHL9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF2IRD1Q9UHL9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF2IRD1Q9UHL9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF2IRD1Q9UHL9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF2IRD1Q9UHL9 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF2IRD1Q9UHL9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF2IRD1Q9UHL9 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF2IRD1Q9UHL9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF2IRD1Q9UHL9 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF2IRD1Q9UHL9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF2IRD1Q9UHL9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF2IRD1Q9UHL9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF2IRD1Q9UHL9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF2IRD1Q9UHL9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF2IRD1Q9UHL9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF2IRD1Q9UHL9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF2IRD1Q9UHL9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF2IRD1Q9UHL9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF2IRD1Q9UHL9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF2IRD1Q9UHL9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF2IRD1Q9UHL9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF2IRD1Q9UHL9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF2IRD1Q9UHL9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF2IRD1Q9UHL9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF2IRD1Q9UHL9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF2IRD1Q9UHL9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF2IRD1Q9UHL9 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF2IRD1Q9UHL9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF2IRD1Q9UHL9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF2IRD1Q9UHL9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF2IRD1Q9UHL9 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF2IRD1Q9UHL9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF2IRD1Q9UHL9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF2IRD1Q9UHL9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF2IRD1Q9UHL9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF2IRD1Q9UHL9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF2IRD1Q9UHL9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF2IRD1Q9UHL9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF2IRD1Q9UHL9 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF2IRD1Q9UHL9 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF2IRD1Q9UHL9 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF2IRD1Q9UHL9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF2IRD1Q9UHL9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF2IRD1Q9UHL9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF2IRD1Q9UHL9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF2IRD1Q9UHL9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF2IRD1Q9UHL9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF2IRD1Q9UHL9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF2IRD1Q9UHL9 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF2IRD1Q9UHL9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF2IRD1Q9UHL9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF2IRD1Q9UHL9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF2IRD1Q9UHL9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF2IRD1Q9UHL9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF2IRD1Q9UHL9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF2IRD1Q9UHL9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF2IRD1Q9UHL9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF2IRD1Q9UHL9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF2IRD1Q9UHL9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF2IRD1Q9UHL9 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF2IRD1Q9UHL9 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF2IRD1Q9UHL9 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF2IRD1Q9UHL9 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF2IRD1Q9UHL9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF2IRD1Q9UHL9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF2IRD1Q9UHL9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF2IRD1Q9UHL9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF2IRD1Q9UHL9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms