Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K1

CC2D2A, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D2AQ9P2K1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
CC2D2AQ9P2K1 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC40.63■■■■■ 4.09
CC2D2AQ9P2K1 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC40.63■■■■■ 4.09
CC2D2AQ9P2K1 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC40.63■■■■■ 4.09
CC2D2AQ9P2K1 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
CC2D2AQ9P2K1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC40.63■■■■■ 4.09
CC2D2AQ9P2K1 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC40.63■■■■■ 4.09
CC2D2AQ9P2K1 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC40.62■■■■■ 4.09
CC2D2AQ9P2K1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
CC2D2AQ9P2K1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC40.62■■■■■ 4.09
CC2D2AQ9P2K1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC40.62■■■■■ 4.09
CC2D2AQ9P2K1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC40.62■■■■■ 4.09
CC2D2AQ9P2K1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
CC2D2AQ9P2K1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
CC2D2AQ9P2K1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.61■■■■■ 4.09
CC2D2AQ9P2K1 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC40.61■■■■■ 4.09
CC2D2AQ9P2K1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC40.61■■■■■ 4.09
CC2D2AQ9P2K1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.61■■■■■ 4.09
CC2D2AQ9P2K1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.61■■■■■ 4.09
CC2D2AQ9P2K1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
CC2D2AQ9P2K1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC40.6■■■■■ 4.09
CC2D2AQ9P2K1 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC40.6■■■■■ 4.09
CC2D2AQ9P2K1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC40.6■■■■■ 4.09
CC2D2AQ9P2K1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC40.6■■■■■ 4.09
CC2D2AQ9P2K1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
CC2D2AQ9P2K1 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
CC2D2AQ9P2K1 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC40.6■■■■■ 4.09
CC2D2AQ9P2K1 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC40.6■■■■■ 4.09
CC2D2AQ9P2K1 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC40.6■■■■■ 4.09
CC2D2AQ9P2K1 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.6■■■■■ 4.09
CC2D2AQ9P2K1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
CC2D2AQ9P2K1 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
CC2D2AQ9P2K1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
CC2D2AQ9P2K1 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
CC2D2AQ9P2K1 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC40.59■■■■■ 4.09
CC2D2AQ9P2K1 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC40.59■■■■■ 4.09
CC2D2AQ9P2K1 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC40.58■■■■■ 4.09
CC2D2AQ9P2K1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
CC2D2AQ9P2K1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.58■■■■■ 4.09
CC2D2AQ9P2K1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
CC2D2AQ9P2K1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.58■■■■■ 4.09
CC2D2AQ9P2K1 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.57■■■■■ 4.09
CC2D2AQ9P2K1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.08
CC2D2AQ9P2K1 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
CC2D2AQ9P2K1 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC40.56■■■■■ 4.08
CC2D2AQ9P2K1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC40.56■■■■■ 4.08
CC2D2AQ9P2K1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
CC2D2AQ9P2K1 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC40.56■■■■■ 4.08
CC2D2AQ9P2K1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC40.56■■■■■ 4.08
CC2D2AQ9P2K1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
CC2D2AQ9P2K1 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC40.55■■■■■ 4.08
CC2D2AQ9P2K1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC40.55■■■■■ 4.08
CC2D2AQ9P2K1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC40.55■■■■■ 4.08
CC2D2AQ9P2K1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.55■■■■■ 4.08
CC2D2AQ9P2K1 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC40.54■■■■■ 4.08
CC2D2AQ9P2K1 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
CC2D2AQ9P2K1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
CC2D2AQ9P2K1 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.53■■■■■ 4.08
CC2D2AQ9P2K1 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
CC2D2AQ9P2K1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC40.53■■■■■ 4.08
CC2D2AQ9P2K1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
CC2D2AQ9P2K1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC40.53■■■■■ 4.08
CC2D2AQ9P2K1 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
CC2D2AQ9P2K1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.52■■■■■ 4.08
CC2D2AQ9P2K1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
CC2D2AQ9P2K1 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
CC2D2AQ9P2K1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC40.52■■■■■ 4.08
CC2D2AQ9P2K1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
CC2D2AQ9P2K1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
CC2D2AQ9P2K1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC40.51■■■■■ 4.08
CC2D2AQ9P2K1 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC40.51■■■■■ 4.08
CC2D2AQ9P2K1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC40.51■■■■■ 4.08
CC2D2AQ9P2K1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.51■■■■■ 4.08
CC2D2AQ9P2K1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
CC2D2AQ9P2K1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC40.51■■■■■ 4.07
CC2D2AQ9P2K1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.5■■■■■ 4.07
CC2D2AQ9P2K1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC40.5■■■■■ 4.07
CC2D2AQ9P2K1 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC40.5■■■■■ 4.07
CC2D2AQ9P2K1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
CC2D2AQ9P2K1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
CC2D2AQ9P2K1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC40.49■■■■■ 4.07
CC2D2AQ9P2K1 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC40.49■■■■■ 4.07
CC2D2AQ9P2K1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
CC2D2AQ9P2K1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
CC2D2AQ9P2K1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
CC2D2AQ9P2K1 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC40.49■■■■■ 4.07
CC2D2AQ9P2K1 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
CC2D2AQ9P2K1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC40.48■■■■■ 4.07
CC2D2AQ9P2K1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
CC2D2AQ9P2K1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
CC2D2AQ9P2K1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
CC2D2AQ9P2K1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
CC2D2AQ9P2K1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
CC2D2AQ9P2K1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
CC2D2AQ9P2K1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC40.47■■■■■ 4.07
CC2D2AQ9P2K1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC40.47■■■■■ 4.07
CC2D2AQ9P2K1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC40.47■■■■■ 4.07
CC2D2AQ9P2K1 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC40.47■■■■■ 4.07
CC2D2AQ9P2K1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
CC2D2AQ9P2K1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms