Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NKIRAS1Q9NYS0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NKIRAS1Q9NYS0 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NKIRAS1Q9NYS0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NKIRAS1Q9NYS0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NKIRAS1Q9NYS0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NKIRAS1Q9NYS0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NKIRAS1Q9NYS0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NKIRAS1Q9NYS0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NKIRAS1Q9NYS0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NKIRAS1Q9NYS0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NKIRAS1Q9NYS0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NKIRAS1Q9NYS0 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NKIRAS1Q9NYS0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NKIRAS1Q9NYS0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NKIRAS1Q9NYS0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NKIRAS1Q9NYS0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NKIRAS1Q9NYS0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NKIRAS1Q9NYS0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NKIRAS1Q9NYS0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NKIRAS1Q9NYS0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NKIRAS1Q9NYS0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NKIRAS1Q9NYS0 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NKIRAS1Q9NYS0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NKIRAS1Q9NYS0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NKIRAS1Q9NYS0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NKIRAS1Q9NYS0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NKIRAS1Q9NYS0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NKIRAS1Q9NYS0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NKIRAS1Q9NYS0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NKIRAS1Q9NYS0 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NKIRAS1Q9NYS0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NKIRAS1Q9NYS0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NKIRAS1Q9NYS0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NKIRAS1Q9NYS0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NKIRAS1Q9NYS0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NKIRAS1Q9NYS0 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NKIRAS1Q9NYS0 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NKIRAS1Q9NYS0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NKIRAS1Q9NYS0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NKIRAS1Q9NYS0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NKIRAS1Q9NYS0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NKIRAS1Q9NYS0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NKIRAS1Q9NYS0 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NKIRAS1Q9NYS0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NKIRAS1Q9NYS0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NKIRAS1Q9NYS0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NKIRAS1Q9NYS0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NKIRAS1Q9NYS0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NKIRAS1Q9NYS0 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NKIRAS1Q9NYS0 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NKIRAS1Q9NYS0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NKIRAS1Q9NYS0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NKIRAS1Q9NYS0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NKIRAS1Q9NYS0 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NKIRAS1Q9NYS0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NKIRAS1Q9NYS0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NKIRAS1Q9NYS0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NKIRAS1Q9NYS0 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NKIRAS1Q9NYS0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NKIRAS1Q9NYS0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NKIRAS1Q9NYS0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NKIRAS1Q9NYS0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NKIRAS1Q9NYS0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NKIRAS1Q9NYS0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NKIRAS1Q9NYS0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NKIRAS1Q9NYS0 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NKIRAS1Q9NYS0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NKIRAS1Q9NYS0 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NKIRAS1Q9NYS0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NKIRAS1Q9NYS0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NKIRAS1Q9NYS0 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NKIRAS1Q9NYS0 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NKIRAS1Q9NYS0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NKIRAS1Q9NYS0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NKIRAS1Q9NYS0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NKIRAS1Q9NYS0 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NKIRAS1Q9NYS0 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NKIRAS1Q9NYS0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NKIRAS1Q9NYS0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NKIRAS1Q9NYS0 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NKIRAS1Q9NYS0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NKIRAS1Q9NYS0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NKIRAS1Q9NYS0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NKIRAS1Q9NYS0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NKIRAS1Q9NYS0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NKIRAS1Q9NYS0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NKIRAS1Q9NYS0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
NKIRAS1Q9NYS0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NKIRAS1Q9NYS0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NKIRAS1Q9NYS0 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NKIRAS1Q9NYS0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NKIRAS1Q9NYS0 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NKIRAS1Q9NYS0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NKIRAS1Q9NYS0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NKIRAS1Q9NYS0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NKIRAS1Q9NYS0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms