Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC39A9Q9NUM3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC39A9Q9NUM3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC39A9Q9NUM3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC39A9Q9NUM3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC39A9Q9NUM3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SLC39A9Q9NUM3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC39A9Q9NUM3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC39A9Q9NUM3 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC39A9Q9NUM3 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC39A9Q9NUM3 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC39A9Q9NUM3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC39A9Q9NUM3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC39A9Q9NUM3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC39A9Q9NUM3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC39A9Q9NUM3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC39A9Q9NUM3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC39A9Q9NUM3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC39A9Q9NUM3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC39A9Q9NUM3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC39A9Q9NUM3 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC39A9Q9NUM3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC39A9Q9NUM3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC39A9Q9NUM3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC39A9Q9NUM3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC39A9Q9NUM3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC39A9Q9NUM3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC39A9Q9NUM3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC39A9Q9NUM3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC39A9Q9NUM3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC39A9Q9NUM3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC39A9Q9NUM3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC39A9Q9NUM3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC39A9Q9NUM3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC39A9Q9NUM3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC39A9Q9NUM3 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC39A9Q9NUM3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC39A9Q9NUM3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC39A9Q9NUM3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC39A9Q9NUM3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC39A9Q9NUM3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC39A9Q9NUM3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC39A9Q9NUM3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC39A9Q9NUM3 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC39A9Q9NUM3 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC39A9Q9NUM3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC39A9Q9NUM3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC39A9Q9NUM3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC39A9Q9NUM3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC39A9Q9NUM3 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC39A9Q9NUM3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC39A9Q9NUM3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC39A9Q9NUM3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC39A9Q9NUM3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC39A9Q9NUM3 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC39A9Q9NUM3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC39A9Q9NUM3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC39A9Q9NUM3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC39A9Q9NUM3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC39A9Q9NUM3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC39A9Q9NUM3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC39A9Q9NUM3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC39A9Q9NUM3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC39A9Q9NUM3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC39A9Q9NUM3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC39A9Q9NUM3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC39A9Q9NUM3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC39A9Q9NUM3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC39A9Q9NUM3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SLC39A9Q9NUM3 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SLC39A9Q9NUM3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SLC39A9Q9NUM3 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC39A9Q9NUM3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC39A9Q9NUM3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC39A9Q9NUM3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC39A9Q9NUM3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC39A9Q9NUM3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC39A9Q9NUM3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC39A9Q9NUM3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC39A9Q9NUM3 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC39A9Q9NUM3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC39A9Q9NUM3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC39A9Q9NUM3 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC39A9Q9NUM3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC39A9Q9NUM3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC39A9Q9NUM3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC39A9Q9NUM3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC39A9Q9NUM3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC39A9Q9NUM3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC39A9Q9NUM3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC39A9Q9NUM3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC39A9Q9NUM3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC39A9Q9NUM3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC39A9Q9NUM3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC39A9Q9NUM3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC39A9Q9NUM3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC39A9Q9NUM3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC39A9Q9NUM3 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC39A9Q9NUM3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC39A9Q9NUM3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms