Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TM7SF3Q9NS93 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TM7SF3Q9NS93 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TM7SF3Q9NS93 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TM7SF3Q9NS93 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TM7SF3Q9NS93 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TM7SF3Q9NS93 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TM7SF3Q9NS93 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TM7SF3Q9NS93 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TM7SF3Q9NS93 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TM7SF3Q9NS93 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TM7SF3Q9NS93 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TM7SF3Q9NS93 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TM7SF3Q9NS93 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TM7SF3Q9NS93 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TM7SF3Q9NS93 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TM7SF3Q9NS93 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TM7SF3Q9NS93 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TM7SF3Q9NS93 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TM7SF3Q9NS93 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TM7SF3Q9NS93 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TM7SF3Q9NS93 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TM7SF3Q9NS93 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TM7SF3Q9NS93 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM7SF3Q9NS93 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM7SF3Q9NS93 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM7SF3Q9NS93 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM7SF3Q9NS93 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM7SF3Q9NS93 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM7SF3Q9NS93 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM7SF3Q9NS93 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM7SF3Q9NS93 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM7SF3Q9NS93 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM7SF3Q9NS93 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM7SF3Q9NS93 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM7SF3Q9NS93 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM7SF3Q9NS93 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TM7SF3Q9NS93 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM7SF3Q9NS93 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM7SF3Q9NS93 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM7SF3Q9NS93 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM7SF3Q9NS93 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM7SF3Q9NS93 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM7SF3Q9NS93 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM7SF3Q9NS93 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM7SF3Q9NS93 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM7SF3Q9NS93 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM7SF3Q9NS93 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM7SF3Q9NS93 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM7SF3Q9NS93 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM7SF3Q9NS93 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM7SF3Q9NS93 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM7SF3Q9NS93 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TM7SF3Q9NS93 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TM7SF3Q9NS93 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TM7SF3Q9NS93 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TM7SF3Q9NS93 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TM7SF3Q9NS93 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TM7SF3Q9NS93 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TM7SF3Q9NS93 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TM7SF3Q9NS93 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TM7SF3Q9NS93 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TM7SF3Q9NS93 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TM7SF3Q9NS93 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TM7SF3Q9NS93 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TM7SF3Q9NS93 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TM7SF3Q9NS93 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TM7SF3Q9NS93 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TM7SF3Q9NS93 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TM7SF3Q9NS93 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TM7SF3Q9NS93 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TM7SF3Q9NS93 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TM7SF3Q9NS93 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TM7SF3Q9NS93 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TM7SF3Q9NS93 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TM7SF3Q9NS93 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TM7SF3Q9NS93 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TM7SF3Q9NS93 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TM7SF3Q9NS93 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TM7SF3Q9NS93 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TM7SF3Q9NS93 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TM7SF3Q9NS93 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TM7SF3Q9NS93 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TM7SF3Q9NS93 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TM7SF3Q9NS93 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TM7SF3Q9NS93 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TM7SF3Q9NS93 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TM7SF3Q9NS93 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TM7SF3Q9NS93 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TM7SF3Q9NS93 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TM7SF3Q9NS93 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TM7SF3Q9NS93 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TM7SF3Q9NS93 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TM7SF3Q9NS93 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TM7SF3Q9NS93 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TM7SF3Q9NS93 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TM7SF3Q9NS93 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TM7SF3Q9NS93 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TM7SF3Q9NS93 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TM7SF3Q9NS93 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms