Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHST12Q9NRB3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHST12Q9NRB3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHST12Q9NRB3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHST12Q9NRB3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHST12Q9NRB3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHST12Q9NRB3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHST12Q9NRB3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHST12Q9NRB3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHST12Q9NRB3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHST12Q9NRB3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHST12Q9NRB3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHST12Q9NRB3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHST12Q9NRB3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHST12Q9NRB3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHST12Q9NRB3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHST12Q9NRB3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHST12Q9NRB3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHST12Q9NRB3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHST12Q9NRB3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHST12Q9NRB3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHST12Q9NRB3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHST12Q9NRB3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHST12Q9NRB3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CHST12Q9NRB3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHST12Q9NRB3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHST12Q9NRB3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHST12Q9NRB3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHST12Q9NRB3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHST12Q9NRB3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHST12Q9NRB3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHST12Q9NRB3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHST12Q9NRB3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHST12Q9NRB3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHST12Q9NRB3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHST12Q9NRB3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CHST12Q9NRB3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CHST12Q9NRB3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CHST12Q9NRB3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHST12Q9NRB3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHST12Q9NRB3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHST12Q9NRB3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHST12Q9NRB3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHST12Q9NRB3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHST12Q9NRB3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHST12Q9NRB3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHST12Q9NRB3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CHST12Q9NRB3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHST12Q9NRB3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHST12Q9NRB3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHST12Q9NRB3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHST12Q9NRB3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHST12Q9NRB3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHST12Q9NRB3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHST12Q9NRB3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHST12Q9NRB3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHST12Q9NRB3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHST12Q9NRB3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHST12Q9NRB3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHST12Q9NRB3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHST12Q9NRB3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHST12Q9NRB3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHST12Q9NRB3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHST12Q9NRB3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHST12Q9NRB3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CHST12Q9NRB3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHST12Q9NRB3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHST12Q9NRB3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CHST12Q9NRB3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CHST12Q9NRB3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CHST12Q9NRB3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CHST12Q9NRB3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CHST12Q9NRB3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CHST12Q9NRB3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CHST12Q9NRB3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHST12Q9NRB3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHST12Q9NRB3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHST12Q9NRB3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CHST12Q9NRB3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CHST12Q9NRB3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CHST12Q9NRB3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHST12Q9NRB3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHST12Q9NRB3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CHST12Q9NRB3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHST12Q9NRB3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHST12Q9NRB3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHST12Q9NRB3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHST12Q9NRB3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHST12Q9NRB3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHST12Q9NRB3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHST12Q9NRB3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHST12Q9NRB3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHST12Q9NRB3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHST12Q9NRB3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHST12Q9NRB3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHST12Q9NRB3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHST12Q9NRB3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CHST12Q9NRB3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHST12Q9NRB3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHST12Q9NRB3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms