Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ0

TNRC6C, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6CQ9HCJ0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TNRC6CQ9HCJ0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TNRC6CQ9HCJ0 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TNRC6CQ9HCJ0 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TNRC6CQ9HCJ0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TNRC6CQ9HCJ0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TNRC6CQ9HCJ0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNRC6CQ9HCJ0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNRC6CQ9HCJ0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNRC6CQ9HCJ0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNRC6CQ9HCJ0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNRC6CQ9HCJ0 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TNRC6CQ9HCJ0 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TNRC6CQ9HCJ0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNRC6CQ9HCJ0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TNRC6CQ9HCJ0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNRC6CQ9HCJ0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNRC6CQ9HCJ0 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNRC6CQ9HCJ0 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNRC6CQ9HCJ0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
TNRC6CQ9HCJ0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNRC6CQ9HCJ0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNRC6CQ9HCJ0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNRC6CQ9HCJ0 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNRC6CQ9HCJ0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNRC6CQ9HCJ0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNRC6CQ9HCJ0 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNRC6CQ9HCJ0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNRC6CQ9HCJ0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNRC6CQ9HCJ0 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
TNRC6CQ9HCJ0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNRC6CQ9HCJ0 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNRC6CQ9HCJ0 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNRC6CQ9HCJ0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNRC6CQ9HCJ0 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNRC6CQ9HCJ0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNRC6CQ9HCJ0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TNRC6CQ9HCJ0 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
TNRC6CQ9HCJ0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TNRC6CQ9HCJ0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TNRC6CQ9HCJ0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TNRC6CQ9HCJ0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNRC6CQ9HCJ0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNRC6CQ9HCJ0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNRC6CQ9HCJ0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNRC6CQ9HCJ0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNRC6CQ9HCJ0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNRC6CQ9HCJ0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNRC6CQ9HCJ0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNRC6CQ9HCJ0 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNRC6CQ9HCJ0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNRC6CQ9HCJ0 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TNRC6CQ9HCJ0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TNRC6CQ9HCJ0 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
TNRC6CQ9HCJ0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TNRC6CQ9HCJ0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TNRC6CQ9HCJ0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TNRC6CQ9HCJ0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TNRC6CQ9HCJ0 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TNRC6CQ9HCJ0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TNRC6CQ9HCJ0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TNRC6CQ9HCJ0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TNRC6CQ9HCJ0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNRC6CQ9HCJ0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNRC6CQ9HCJ0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNRC6CQ9HCJ0 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNRC6CQ9HCJ0 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNRC6CQ9HCJ0 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNRC6CQ9HCJ0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNRC6CQ9HCJ0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNRC6CQ9HCJ0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNRC6CQ9HCJ0 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TNRC6CQ9HCJ0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TNRC6CQ9HCJ0 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TNRC6CQ9HCJ0 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TNRC6CQ9HCJ0 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TNRC6CQ9HCJ0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TNRC6CQ9HCJ0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TNRC6CQ9HCJ0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TNRC6CQ9HCJ0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TNRC6CQ9HCJ0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TNRC6CQ9HCJ0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TNRC6CQ9HCJ0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TNRC6CQ9HCJ0 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TNRC6CQ9HCJ0 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TNRC6CQ9HCJ0 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TNRC6CQ9HCJ0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TNRC6CQ9HCJ0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TNRC6CQ9HCJ0 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TNRC6CQ9HCJ0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TNRC6CQ9HCJ0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TNRC6CQ9HCJ0 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TNRC6CQ9HCJ0 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
TNRC6CQ9HCJ0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TNRC6CQ9HCJ0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TNRC6CQ9HCJ0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
TNRC6CQ9HCJ0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TNRC6CQ9HCJ0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TNRC6CQ9HCJ0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TNRC6CQ9HCJ0 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms