Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C11orf49Q9H6J7 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
C11orf49Q9H6J7 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
C11orf49Q9H6J7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C11orf49Q9H6J7 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
C11orf49Q9H6J7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C11orf49Q9H6J7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C11orf49Q9H6J7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C11orf49Q9H6J7 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C11orf49Q9H6J7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C11orf49Q9H6J7 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C11orf49Q9H6J7 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C11orf49Q9H6J7 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C11orf49Q9H6J7 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C11orf49Q9H6J7 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C11orf49Q9H6J7 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C11orf49Q9H6J7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C11orf49Q9H6J7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C11orf49Q9H6J7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C11orf49Q9H6J7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C11orf49Q9H6J7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C11orf49Q9H6J7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C11orf49Q9H6J7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C11orf49Q9H6J7 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C11orf49Q9H6J7 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C11orf49Q9H6J7 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C11orf49Q9H6J7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C11orf49Q9H6J7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C11orf49Q9H6J7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C11orf49Q9H6J7 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C11orf49Q9H6J7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C11orf49Q9H6J7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C11orf49Q9H6J7 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C11orf49Q9H6J7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C11orf49Q9H6J7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C11orf49Q9H6J7 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C11orf49Q9H6J7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C11orf49Q9H6J7 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C11orf49Q9H6J7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C11orf49Q9H6J7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C11orf49Q9H6J7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C11orf49Q9H6J7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C11orf49Q9H6J7 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C11orf49Q9H6J7 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C11orf49Q9H6J7 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
C11orf49Q9H6J7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C11orf49Q9H6J7 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C11orf49Q9H6J7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C11orf49Q9H6J7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C11orf49Q9H6J7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C11orf49Q9H6J7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C11orf49Q9H6J7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
C11orf49Q9H6J7 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C11orf49Q9H6J7 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C11orf49Q9H6J7 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
C11orf49Q9H6J7 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
C11orf49Q9H6J7 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
C11orf49Q9H6J7 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C11orf49Q9H6J7 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C11orf49Q9H6J7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
C11orf49Q9H6J7 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
C11orf49Q9H6J7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
C11orf49Q9H6J7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
C11orf49Q9H6J7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
C11orf49Q9H6J7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C11orf49Q9H6J7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C11orf49Q9H6J7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
C11orf49Q9H6J7 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C11orf49Q9H6J7 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
C11orf49Q9H6J7 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
C11orf49Q9H6J7 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
C11orf49Q9H6J7 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
C11orf49Q9H6J7 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
C11orf49Q9H6J7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C11orf49Q9H6J7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C11orf49Q9H6J7 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C11orf49Q9H6J7 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C11orf49Q9H6J7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C11orf49Q9H6J7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C11orf49Q9H6J7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C11orf49Q9H6J7 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C11orf49Q9H6J7 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C11orf49Q9H6J7 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C11orf49Q9H6J7 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C11orf49Q9H6J7 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C11orf49Q9H6J7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C11orf49Q9H6J7 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C11orf49Q9H6J7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C11orf49Q9H6J7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C11orf49Q9H6J7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C11orf49Q9H6J7 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C11orf49Q9H6J7 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C11orf49Q9H6J7 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
C11orf49Q9H6J7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C11orf49Q9H6J7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C11orf49Q9H6J7 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C11orf49Q9H6J7 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C11orf49Q9H6J7 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C11orf49Q9H6J7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C11orf49Q9H6J7 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms