Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY5

Cbx6, Chromobox protein homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx6Q9DBY5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cbx6Q9DBY5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cbx6Q9DBY5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cbx6Q9DBY5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cbx6Q9DBY5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cbx6Q9DBY5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cbx6Q9DBY5 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cbx6Q9DBY5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cbx6Q9DBY5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cbx6Q9DBY5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cbx6Q9DBY5 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cbx6Q9DBY5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cbx6Q9DBY5 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cbx6Q9DBY5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cbx6Q9DBY5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cbx6Q9DBY5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cbx6Q9DBY5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cbx6Q9DBY5 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cbx6Q9DBY5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cbx6Q9DBY5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cbx6Q9DBY5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cbx6Q9DBY5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cbx6Q9DBY5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cbx6Q9DBY5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cbx6Q9DBY5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cbx6Q9DBY5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cbx6Q9DBY5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cbx6Q9DBY5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cbx6Q9DBY5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cbx6Q9DBY5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cbx6Q9DBY5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Cbx6Q9DBY5 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cbx6Q9DBY5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cbx6Q9DBY5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cbx6Q9DBY5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cbx6Q9DBY5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cbx6Q9DBY5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cbx6Q9DBY5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cbx6Q9DBY5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cbx6Q9DBY5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cbx6Q9DBY5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cbx6Q9DBY5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cbx6Q9DBY5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cbx6Q9DBY5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cbx6Q9DBY5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cbx6Q9DBY5 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cbx6Q9DBY5 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cbx6Q9DBY5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cbx6Q9DBY5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cbx6Q9DBY5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Cbx6Q9DBY5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cbx6Q9DBY5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cbx6Q9DBY5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cbx6Q9DBY5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cbx6Q9DBY5 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cbx6Q9DBY5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cbx6Q9DBY5 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cbx6Q9DBY5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cbx6Q9DBY5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Cbx6Q9DBY5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cbx6Q9DBY5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cbx6Q9DBY5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cbx6Q9DBY5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cbx6Q9DBY5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cbx6Q9DBY5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cbx6Q9DBY5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cbx6Q9DBY5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cbx6Q9DBY5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cbx6Q9DBY5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cbx6Q9DBY5 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cbx6Q9DBY5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cbx6Q9DBY5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cbx6Q9DBY5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cbx6Q9DBY5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cbx6Q9DBY5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cbx6Q9DBY5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cbx6Q9DBY5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cbx6Q9DBY5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cbx6Q9DBY5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cbx6Q9DBY5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cbx6Q9DBY5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Cbx6Q9DBY5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cbx6Q9DBY5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Cbx6Q9DBY5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Cbx6Q9DBY5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cbx6Q9DBY5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cbx6Q9DBY5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cbx6Q9DBY5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cbx6Q9DBY5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cbx6Q9DBY5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cbx6Q9DBY5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Cbx6Q9DBY5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cbx6Q9DBY5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cbx6Q9DBY5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cbx6Q9DBY5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cbx6Q9DBY5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cbx6Q9DBY5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cbx6Q9DBY5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cbx6Q9DBY5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cbx6Q9DBY5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.8 ms