Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX4

Pclaf, PCNA-associated factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PclafQ9CQX4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PclafQ9CQX4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PclafQ9CQX4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PclafQ9CQX4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PclafQ9CQX4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PclafQ9CQX4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PclafQ9CQX4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PclafQ9CQX4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PclafQ9CQX4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PclafQ9CQX4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PclafQ9CQX4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PclafQ9CQX4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PclafQ9CQX4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PclafQ9CQX4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PclafQ9CQX4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PclafQ9CQX4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PclafQ9CQX4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PclafQ9CQX4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PclafQ9CQX4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PclafQ9CQX4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PclafQ9CQX4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PclafQ9CQX4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PclafQ9CQX4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PclafQ9CQX4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PclafQ9CQX4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PclafQ9CQX4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PclafQ9CQX4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PclafQ9CQX4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PclafQ9CQX4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PclafQ9CQX4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PclafQ9CQX4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PclafQ9CQX4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PclafQ9CQX4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PclafQ9CQX4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PclafQ9CQX4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PclafQ9CQX4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PclafQ9CQX4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PclafQ9CQX4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PclafQ9CQX4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PclafQ9CQX4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PclafQ9CQX4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PclafQ9CQX4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PclafQ9CQX4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PclafQ9CQX4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PclafQ9CQX4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PclafQ9CQX4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PclafQ9CQX4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PclafQ9CQX4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PclafQ9CQX4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PclafQ9CQX4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PclafQ9CQX4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PclafQ9CQX4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PclafQ9CQX4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PclafQ9CQX4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PclafQ9CQX4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PclafQ9CQX4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PclafQ9CQX4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PclafQ9CQX4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PclafQ9CQX4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PclafQ9CQX4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PclafQ9CQX4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PclafQ9CQX4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PclafQ9CQX4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PclafQ9CQX4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PclafQ9CQX4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PclafQ9CQX4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PclafQ9CQX4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PclafQ9CQX4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PclafQ9CQX4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PclafQ9CQX4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PclafQ9CQX4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PclafQ9CQX4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PclafQ9CQX4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PclafQ9CQX4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PclafQ9CQX4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PclafQ9CQX4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PclafQ9CQX4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PclafQ9CQX4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PclafQ9CQX4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PclafQ9CQX4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PclafQ9CQX4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PclafQ9CQX4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PclafQ9CQX4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PclafQ9CQX4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PclafQ9CQX4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PclafQ9CQX4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PclafQ9CQX4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PclafQ9CQX4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PclafQ9CQX4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PclafQ9CQX4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PclafQ9CQX4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PclafQ9CQX4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PclafQ9CQX4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PclafQ9CQX4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PclafQ9CQX4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PclafQ9CQX4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PclafQ9CQX4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PclafQ9CQX4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PclafQ9CQX4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PclafQ9CQX4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms