Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY77

POLDIP3, Polymerase delta-interacting protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLDIP3Q9BY77 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLDIP3Q9BY77 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLDIP3Q9BY77 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLDIP3Q9BY77 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLDIP3Q9BY77 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLDIP3Q9BY77 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLDIP3Q9BY77 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
POLDIP3Q9BY77 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLDIP3Q9BY77 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLDIP3Q9BY77 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLDIP3Q9BY77 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
POLDIP3Q9BY77 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLDIP3Q9BY77 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
POLDIP3Q9BY77 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLDIP3Q9BY77 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLDIP3Q9BY77 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLDIP3Q9BY77 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLDIP3Q9BY77 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLDIP3Q9BY77 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLDIP3Q9BY77 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLDIP3Q9BY77 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLDIP3Q9BY77 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLDIP3Q9BY77 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLDIP3Q9BY77 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLDIP3Q9BY77 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLDIP3Q9BY77 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLDIP3Q9BY77 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLDIP3Q9BY77 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLDIP3Q9BY77 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLDIP3Q9BY77 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
POLDIP3Q9BY77 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLDIP3Q9BY77 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLDIP3Q9BY77 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLDIP3Q9BY77 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLDIP3Q9BY77 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLDIP3Q9BY77 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLDIP3Q9BY77 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLDIP3Q9BY77 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLDIP3Q9BY77 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLDIP3Q9BY77 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLDIP3Q9BY77 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
POLDIP3Q9BY77 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLDIP3Q9BY77 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLDIP3Q9BY77 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLDIP3Q9BY77 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLDIP3Q9BY77 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLDIP3Q9BY77 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLDIP3Q9BY77 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLDIP3Q9BY77 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLDIP3Q9BY77 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLDIP3Q9BY77 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLDIP3Q9BY77 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLDIP3Q9BY77 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLDIP3Q9BY77 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLDIP3Q9BY77 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLDIP3Q9BY77 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLDIP3Q9BY77 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLDIP3Q9BY77 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLDIP3Q9BY77 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLDIP3Q9BY77 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLDIP3Q9BY77 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLDIP3Q9BY77 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLDIP3Q9BY77 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
POLDIP3Q9BY77 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLDIP3Q9BY77 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLDIP3Q9BY77 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLDIP3Q9BY77 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
POLDIP3Q9BY77 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLDIP3Q9BY77 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLDIP3Q9BY77 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLDIP3Q9BY77 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLDIP3Q9BY77 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLDIP3Q9BY77 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLDIP3Q9BY77 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLDIP3Q9BY77 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLDIP3Q9BY77 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLDIP3Q9BY77 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLDIP3Q9BY77 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLDIP3Q9BY77 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLDIP3Q9BY77 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLDIP3Q9BY77 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLDIP3Q9BY77 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLDIP3Q9BY77 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLDIP3Q9BY77 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLDIP3Q9BY77 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLDIP3Q9BY77 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLDIP3Q9BY77 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLDIP3Q9BY77 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLDIP3Q9BY77 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
POLDIP3Q9BY77 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLDIP3Q9BY77 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLDIP3Q9BY77 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLDIP3Q9BY77 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
POLDIP3Q9BY77 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
POLDIP3Q9BY77 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLDIP3Q9BY77 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLDIP3Q9BY77 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLDIP3Q9BY77 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLDIP3Q9BY77 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLDIP3Q9BY77 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms