Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RSPO3Q9BXY4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RSPO3Q9BXY4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RSPO3Q9BXY4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RSPO3Q9BXY4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RSPO3Q9BXY4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RSPO3Q9BXY4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RSPO3Q9BXY4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RSPO3Q9BXY4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RSPO3Q9BXY4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RSPO3Q9BXY4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RSPO3Q9BXY4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RSPO3Q9BXY4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RSPO3Q9BXY4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RSPO3Q9BXY4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RSPO3Q9BXY4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RSPO3Q9BXY4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RSPO3Q9BXY4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RSPO3Q9BXY4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RSPO3Q9BXY4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RSPO3Q9BXY4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RSPO3Q9BXY4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RSPO3Q9BXY4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RSPO3Q9BXY4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RSPO3Q9BXY4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RSPO3Q9BXY4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RSPO3Q9BXY4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RSPO3Q9BXY4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RSPO3Q9BXY4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RSPO3Q9BXY4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RSPO3Q9BXY4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RSPO3Q9BXY4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RSPO3Q9BXY4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RSPO3Q9BXY4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RSPO3Q9BXY4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RSPO3Q9BXY4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RSPO3Q9BXY4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RSPO3Q9BXY4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RSPO3Q9BXY4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RSPO3Q9BXY4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RSPO3Q9BXY4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
RSPO3Q9BXY4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RSPO3Q9BXY4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RSPO3Q9BXY4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RSPO3Q9BXY4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RSPO3Q9BXY4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RSPO3Q9BXY4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RSPO3Q9BXY4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RSPO3Q9BXY4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RSPO3Q9BXY4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RSPO3Q9BXY4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RSPO3Q9BXY4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RSPO3Q9BXY4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RSPO3Q9BXY4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RSPO3Q9BXY4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RSPO3Q9BXY4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RSPO3Q9BXY4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RSPO3Q9BXY4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RSPO3Q9BXY4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RSPO3Q9BXY4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RSPO3Q9BXY4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RSPO3Q9BXY4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RSPO3Q9BXY4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RSPO3Q9BXY4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RSPO3Q9BXY4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RSPO3Q9BXY4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RSPO3Q9BXY4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RSPO3Q9BXY4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RSPO3Q9BXY4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RSPO3Q9BXY4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RSPO3Q9BXY4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RSPO3Q9BXY4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RSPO3Q9BXY4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RSPO3Q9BXY4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RSPO3Q9BXY4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RSPO3Q9BXY4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RSPO3Q9BXY4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RSPO3Q9BXY4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RSPO3Q9BXY4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RSPO3Q9BXY4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RSPO3Q9BXY4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RSPO3Q9BXY4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RSPO3Q9BXY4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RSPO3Q9BXY4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RSPO3Q9BXY4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RSPO3Q9BXY4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RSPO3Q9BXY4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RSPO3Q9BXY4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RSPO3Q9BXY4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RSPO3Q9BXY4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RSPO3Q9BXY4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RSPO3Q9BXY4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RSPO3Q9BXY4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RSPO3Q9BXY4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RSPO3Q9BXY4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RSPO3Q9BXY4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RSPO3Q9BXY4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RSPO3Q9BXY4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RSPO3Q9BXY4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RSPO3Q9BXY4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms