Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSJ2

TUBGCP2, Gamma-tubulin complex component 2, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP2Q9BSJ2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBGCP2Q9BSJ2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBGCP2Q9BSJ2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBGCP2Q9BSJ2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBGCP2Q9BSJ2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBGCP2Q9BSJ2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBGCP2Q9BSJ2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBGCP2Q9BSJ2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBGCP2Q9BSJ2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBGCP2Q9BSJ2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBGCP2Q9BSJ2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBGCP2Q9BSJ2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBGCP2Q9BSJ2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBGCP2Q9BSJ2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBGCP2Q9BSJ2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBGCP2Q9BSJ2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBGCP2Q9BSJ2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBGCP2Q9BSJ2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBGCP2Q9BSJ2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBGCP2Q9BSJ2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBGCP2Q9BSJ2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBGCP2Q9BSJ2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBGCP2Q9BSJ2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBGCP2Q9BSJ2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBGCP2Q9BSJ2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBGCP2Q9BSJ2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBGCP2Q9BSJ2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBGCP2Q9BSJ2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBGCP2Q9BSJ2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBGCP2Q9BSJ2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBGCP2Q9BSJ2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBGCP2Q9BSJ2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBGCP2Q9BSJ2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBGCP2Q9BSJ2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBGCP2Q9BSJ2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBGCP2Q9BSJ2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBGCP2Q9BSJ2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBGCP2Q9BSJ2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBGCP2Q9BSJ2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBGCP2Q9BSJ2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBGCP2Q9BSJ2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBGCP2Q9BSJ2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBGCP2Q9BSJ2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBGCP2Q9BSJ2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBGCP2Q9BSJ2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBGCP2Q9BSJ2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBGCP2Q9BSJ2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBGCP2Q9BSJ2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBGCP2Q9BSJ2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBGCP2Q9BSJ2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBGCP2Q9BSJ2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBGCP2Q9BSJ2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBGCP2Q9BSJ2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBGCP2Q9BSJ2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBGCP2Q9BSJ2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBGCP2Q9BSJ2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBGCP2Q9BSJ2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBGCP2Q9BSJ2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBGCP2Q9BSJ2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBGCP2Q9BSJ2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBGCP2Q9BSJ2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBGCP2Q9BSJ2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TUBGCP2Q9BSJ2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TUBGCP2Q9BSJ2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TUBGCP2Q9BSJ2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TUBGCP2Q9BSJ2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TUBGCP2Q9BSJ2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TUBGCP2Q9BSJ2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TUBGCP2Q9BSJ2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TUBGCP2Q9BSJ2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TUBGCP2Q9BSJ2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TUBGCP2Q9BSJ2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBGCP2Q9BSJ2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBGCP2Q9BSJ2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBGCP2Q9BSJ2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBGCP2Q9BSJ2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBGCP2Q9BSJ2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBGCP2Q9BSJ2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBGCP2Q9BSJ2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBGCP2Q9BSJ2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBGCP2Q9BSJ2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBGCP2Q9BSJ2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBGCP2Q9BSJ2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBGCP2Q9BSJ2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBGCP2Q9BSJ2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBGCP2Q9BSJ2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBGCP2Q9BSJ2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBGCP2Q9BSJ2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBGCP2Q9BSJ2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBGCP2Q9BSJ2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBGCP2Q9BSJ2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBGCP2Q9BSJ2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBGCP2Q9BSJ2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBGCP2Q9BSJ2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBGCP2Q9BSJ2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBGCP2Q9BSJ2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBGCP2Q9BSJ2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBGCP2Q9BSJ2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBGCP2Q9BSJ2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBGCP2Q9BSJ2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms