Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPS6KC1Q96S38 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPS6KC1Q96S38 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPS6KC1Q96S38 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPS6KC1Q96S38 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPS6KC1Q96S38 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPS6KC1Q96S38 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPS6KC1Q96S38 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RPS6KC1Q96S38 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPS6KC1Q96S38 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPS6KC1Q96S38 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPS6KC1Q96S38 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPS6KC1Q96S38 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RPS6KC1Q96S38 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPS6KC1Q96S38 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPS6KC1Q96S38 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPS6KC1Q96S38 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPS6KC1Q96S38 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPS6KC1Q96S38 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPS6KC1Q96S38 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPS6KC1Q96S38 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPS6KC1Q96S38 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPS6KC1Q96S38 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPS6KC1Q96S38 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPS6KC1Q96S38 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPS6KC1Q96S38 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPS6KC1Q96S38 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RPS6KC1Q96S38 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPS6KC1Q96S38 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPS6KC1Q96S38 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPS6KC1Q96S38 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RPS6KC1Q96S38 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPS6KC1Q96S38 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPS6KC1Q96S38 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPS6KC1Q96S38 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
RPS6KC1Q96S38 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RPS6KC1Q96S38 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPS6KC1Q96S38 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPS6KC1Q96S38 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPS6KC1Q96S38 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPS6KC1Q96S38 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPS6KC1Q96S38 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPS6KC1Q96S38 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RPS6KC1Q96S38 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPS6KC1Q96S38 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPS6KC1Q96S38 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPS6KC1Q96S38 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPS6KC1Q96S38 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPS6KC1Q96S38 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPS6KC1Q96S38 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPS6KC1Q96S38 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPS6KC1Q96S38 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPS6KC1Q96S38 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RPS6KC1Q96S38 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RPS6KC1Q96S38 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPS6KC1Q96S38 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPS6KC1Q96S38 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPS6KC1Q96S38 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPS6KC1Q96S38 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPS6KC1Q96S38 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPS6KC1Q96S38 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPS6KC1Q96S38 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPS6KC1Q96S38 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPS6KC1Q96S38 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPS6KC1Q96S38 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RPS6KC1Q96S38 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPS6KC1Q96S38 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPS6KC1Q96S38 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RPS6KC1Q96S38 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPS6KC1Q96S38 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPS6KC1Q96S38 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPS6KC1Q96S38 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPS6KC1Q96S38 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPS6KC1Q96S38 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPS6KC1Q96S38 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPS6KC1Q96S38 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPS6KC1Q96S38 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RPS6KC1Q96S38 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RPS6KC1Q96S38 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPS6KC1Q96S38 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RPS6KC1Q96S38 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPS6KC1Q96S38 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPS6KC1Q96S38 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RPS6KC1Q96S38 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPS6KC1Q96S38 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPS6KC1Q96S38 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPS6KC1Q96S38 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPS6KC1Q96S38 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPS6KC1Q96S38 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPS6KC1Q96S38 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPS6KC1Q96S38 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPS6KC1Q96S38 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPS6KC1Q96S38 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPS6KC1Q96S38 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RPS6KC1Q96S38 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPS6KC1Q96S38 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPS6KC1Q96S38 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPS6KC1Q96S38 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPS6KC1Q96S38 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPS6KC1Q96S38 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms