Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NLRP3Q96P20 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NLRP3Q96P20 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NLRP3Q96P20 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NLRP3Q96P20 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NLRP3Q96P20 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NLRP3Q96P20 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NLRP3Q96P20 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NLRP3Q96P20 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NLRP3Q96P20 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NLRP3Q96P20 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NLRP3Q96P20 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NLRP3Q96P20 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NLRP3Q96P20 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NLRP3Q96P20 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NLRP3Q96P20 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NLRP3Q96P20 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NLRP3Q96P20 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NLRP3Q96P20 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NLRP3Q96P20 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NLRP3Q96P20 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NLRP3Q96P20 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NLRP3Q96P20 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NLRP3Q96P20 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NLRP3Q96P20 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NLRP3Q96P20 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NLRP3Q96P20 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NLRP3Q96P20 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NLRP3Q96P20 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NLRP3Q96P20 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NLRP3Q96P20 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NLRP3Q96P20 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NLRP3Q96P20 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NLRP3Q96P20 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NLRP3Q96P20 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NLRP3Q96P20 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NLRP3Q96P20 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NLRP3Q96P20 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NLRP3Q96P20 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NLRP3Q96P20 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NLRP3Q96P20 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NLRP3Q96P20 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NLRP3Q96P20 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NLRP3Q96P20 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NLRP3Q96P20 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NLRP3Q96P20 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NLRP3Q96P20 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NLRP3Q96P20 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NLRP3Q96P20 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NLRP3Q96P20 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NLRP3Q96P20 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NLRP3Q96P20 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NLRP3Q96P20 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NLRP3Q96P20 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NLRP3Q96P20 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NLRP3Q96P20 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NLRP3Q96P20 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NLRP3Q96P20 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NLRP3Q96P20 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NLRP3Q96P20 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NLRP3Q96P20 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NLRP3Q96P20 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NLRP3Q96P20 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NLRP3Q96P20 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NLRP3Q96P20 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
NLRP3Q96P20 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NLRP3Q96P20 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NLRP3Q96P20 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NLRP3Q96P20 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NLRP3Q96P20 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NLRP3Q96P20 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NLRP3Q96P20 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NLRP3Q96P20 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NLRP3Q96P20 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NLRP3Q96P20 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NLRP3Q96P20 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
NLRP3Q96P20 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NLRP3Q96P20 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NLRP3Q96P20 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NLRP3Q96P20 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NLRP3Q96P20 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
NLRP3Q96P20 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NLRP3Q96P20 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
NLRP3Q96P20 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NLRP3Q96P20 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NLRP3Q96P20 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
NLRP3Q96P20 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NLRP3Q96P20 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NLRP3Q96P20 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NLRP3Q96P20 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NLRP3Q96P20 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
NLRP3Q96P20 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NLRP3Q96P20 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NLRP3Q96P20 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NLRP3Q96P20 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NLRP3Q96P20 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NLRP3Q96P20 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NLRP3Q96P20 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NLRP3Q96P20 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NLRP3Q96P20 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms