Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG8

PCMTD1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMTD1Q96MG8 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCMTD1Q96MG8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCMTD1Q96MG8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCMTD1Q96MG8 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCMTD1Q96MG8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCMTD1Q96MG8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PCMTD1Q96MG8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCMTD1Q96MG8 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCMTD1Q96MG8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCMTD1Q96MG8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCMTD1Q96MG8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCMTD1Q96MG8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCMTD1Q96MG8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCMTD1Q96MG8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCMTD1Q96MG8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCMTD1Q96MG8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCMTD1Q96MG8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCMTD1Q96MG8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCMTD1Q96MG8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCMTD1Q96MG8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCMTD1Q96MG8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCMTD1Q96MG8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCMTD1Q96MG8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCMTD1Q96MG8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCMTD1Q96MG8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCMTD1Q96MG8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCMTD1Q96MG8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCMTD1Q96MG8 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCMTD1Q96MG8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCMTD1Q96MG8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCMTD1Q96MG8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCMTD1Q96MG8 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCMTD1Q96MG8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCMTD1Q96MG8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCMTD1Q96MG8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCMTD1Q96MG8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCMTD1Q96MG8 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCMTD1Q96MG8 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCMTD1Q96MG8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCMTD1Q96MG8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PCMTD1Q96MG8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCMTD1Q96MG8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCMTD1Q96MG8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCMTD1Q96MG8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCMTD1Q96MG8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCMTD1Q96MG8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCMTD1Q96MG8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCMTD1Q96MG8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCMTD1Q96MG8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCMTD1Q96MG8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCMTD1Q96MG8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCMTD1Q96MG8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCMTD1Q96MG8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCMTD1Q96MG8 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCMTD1Q96MG8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCMTD1Q96MG8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCMTD1Q96MG8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCMTD1Q96MG8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCMTD1Q96MG8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCMTD1Q96MG8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCMTD1Q96MG8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCMTD1Q96MG8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCMTD1Q96MG8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCMTD1Q96MG8 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCMTD1Q96MG8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCMTD1Q96MG8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCMTD1Q96MG8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCMTD1Q96MG8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCMTD1Q96MG8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCMTD1Q96MG8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCMTD1Q96MG8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCMTD1Q96MG8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCMTD1Q96MG8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PCMTD1Q96MG8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCMTD1Q96MG8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCMTD1Q96MG8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCMTD1Q96MG8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCMTD1Q96MG8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCMTD1Q96MG8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCMTD1Q96MG8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCMTD1Q96MG8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCMTD1Q96MG8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCMTD1Q96MG8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PCMTD1Q96MG8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCMTD1Q96MG8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCMTD1Q96MG8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PCMTD1Q96MG8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCMTD1Q96MG8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCMTD1Q96MG8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCMTD1Q96MG8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PCMTD1Q96MG8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCMTD1Q96MG8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCMTD1Q96MG8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCMTD1Q96MG8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCMTD1Q96MG8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCMTD1Q96MG8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCMTD1Q96MG8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCMTD1Q96MG8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCMTD1Q96MG8 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCMTD1Q96MG8 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms