Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC97Q96F63 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC97Q96F63 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC97Q96F63 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC97Q96F63 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC97Q96F63 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC97Q96F63 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC97Q96F63 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC97Q96F63 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC97Q96F63 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC97Q96F63 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC97Q96F63 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC97Q96F63 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC97Q96F63 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC97Q96F63 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC97Q96F63 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC97Q96F63 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC97Q96F63 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC97Q96F63 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC97Q96F63 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC97Q96F63 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC97Q96F63 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC97Q96F63 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC97Q96F63 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC97Q96F63 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC97Q96F63 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC97Q96F63 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC97Q96F63 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC97Q96F63 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC97Q96F63 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC97Q96F63 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC97Q96F63 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC97Q96F63 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC97Q96F63 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC97Q96F63 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC97Q96F63 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC97Q96F63 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC97Q96F63 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC97Q96F63 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC97Q96F63 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC97Q96F63 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC97Q96F63 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC97Q96F63 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC97Q96F63 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC97Q96F63 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC97Q96F63 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC97Q96F63 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC97Q96F63 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC97Q96F63 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC97Q96F63 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC97Q96F63 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC97Q96F63 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC97Q96F63 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC97Q96F63 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC97Q96F63 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC97Q96F63 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC97Q96F63 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC97Q96F63 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC97Q96F63 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC97Q96F63 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC97Q96F63 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC97Q96F63 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC97Q96F63 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC97Q96F63 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC97Q96F63 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC97Q96F63 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC97Q96F63 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC97Q96F63 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC97Q96F63 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC97Q96F63 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC97Q96F63 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC97Q96F63 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC97Q96F63 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC97Q96F63 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC97Q96F63 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC97Q96F63 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC97Q96F63 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC97Q96F63 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC97Q96F63 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC97Q96F63 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC97Q96F63 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC97Q96F63 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC97Q96F63 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC97Q96F63 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC97Q96F63 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC97Q96F63 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC97Q96F63 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC97Q96F63 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC97Q96F63 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC97Q96F63 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC97Q96F63 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC97Q96F63 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC97Q96F63 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC97Q96F63 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC97Q96F63 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC97Q96F63 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC97Q96F63 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC97Q96F63 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC97Q96F63 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC97Q96F63 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms