Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
PRG4Q92954 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
PRG4Q92954 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
PRG4Q92954 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC35.86■■■■□ 3.33
PRG4Q92954 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC35.86■■■■□ 3.33
PRG4Q92954 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
PRG4Q92954 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
PRG4Q92954 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
PRG4Q92954 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
PRG4Q92954 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
PRG4Q92954 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
PRG4Q92954 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
PRG4Q92954 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
PRG4Q92954 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC35.85■■■■□ 3.33
PRG4Q92954 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
PRG4Q92954 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
PRG4Q92954 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
PRG4Q92954 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
PRG4Q92954 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
PRG4Q92954 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
PRG4Q92954 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
PRG4Q92954 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
PRG4Q92954 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
PRG4Q92954 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
PRG4Q92954 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
PRG4Q92954 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
PRG4Q92954 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC35.83■■■■□ 3.33
PRG4Q92954 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
PRG4Q92954 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
PRG4Q92954 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
PRG4Q92954 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
PRG4Q92954 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
PRG4Q92954 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
PRG4Q92954 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
PRG4Q92954 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
PRG4Q92954 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
PRG4Q92954 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
PRG4Q92954 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
PRG4Q92954 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC35.82■■■■□ 3.33
PRG4Q92954 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
PRG4Q92954 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
PRG4Q92954 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
PRG4Q92954 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
PRG4Q92954 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
PRG4Q92954 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC35.82■■■■□ 3.32
PRG4Q92954 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
PRG4Q92954 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
PRG4Q92954 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
PRG4Q92954 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
PRG4Q92954 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
PRG4Q92954 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
PRG4Q92954 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
PRG4Q92954 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
PRG4Q92954 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
PRG4Q92954 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
PRG4Q92954 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
PRG4Q92954 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
PRG4Q92954 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
PRG4Q92954 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
PRG4Q92954 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
PRG4Q92954 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
PRG4Q92954 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
PRG4Q92954 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
PRG4Q92954 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
PRG4Q92954 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
PRG4Q92954 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
PRG4Q92954 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
PRG4Q92954 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
PRG4Q92954 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
PRG4Q92954 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
PRG4Q92954 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
PRG4Q92954 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
PRG4Q92954 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC35.76■■■■□ 3.32
PRG4Q92954 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC35.76■■■■□ 3.32
PRG4Q92954 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
PRG4Q92954 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.31
PRG4Q92954 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
PRG4Q92954 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
PRG4Q92954 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
PRG4Q92954 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
PRG4Q92954 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
PRG4Q92954 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC35.75■■■■□ 3.31
PRG4Q92954 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
PRG4Q92954 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
PRG4Q92954 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
PRG4Q92954 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
PRG4Q92954 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
PRG4Q92954 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
PRG4Q92954 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
PRG4Q92954 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
PRG4Q92954 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
PRG4Q92954 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
PRG4Q92954 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
PRG4Q92954 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
PRG4Q92954 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
PRG4Q92954 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
PRG4Q92954 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
PRG4Q92954 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
PRG4Q92954 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
PRG4Q92954 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms