Protein–RNA interactions for Protein: Q92925

SMARCD2, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD2Q92925 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMARCD2Q92925 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMARCD2Q92925 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMARCD2Q92925 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMARCD2Q92925 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMARCD2Q92925 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMARCD2Q92925 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMARCD2Q92925 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMARCD2Q92925 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMARCD2Q92925 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMARCD2Q92925 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMARCD2Q92925 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMARCD2Q92925 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMARCD2Q92925 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMARCD2Q92925 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMARCD2Q92925 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMARCD2Q92925 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMARCD2Q92925 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMARCD2Q92925 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMARCD2Q92925 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMARCD2Q92925 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMARCD2Q92925 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMARCD2Q92925 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMARCD2Q92925 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMARCD2Q92925 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMARCD2Q92925 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMARCD2Q92925 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMARCD2Q92925 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMARCD2Q92925 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMARCD2Q92925 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMARCD2Q92925 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMARCD2Q92925 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMARCD2Q92925 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMARCD2Q92925 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMARCD2Q92925 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMARCD2Q92925 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMARCD2Q92925 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMARCD2Q92925 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMARCD2Q92925 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMARCD2Q92925 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMARCD2Q92925 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMARCD2Q92925 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMARCD2Q92925 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMARCD2Q92925 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMARCD2Q92925 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMARCD2Q92925 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMARCD2Q92925 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMARCD2Q92925 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMARCD2Q92925 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMARCD2Q92925 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMARCD2Q92925 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMARCD2Q92925 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMARCD2Q92925 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMARCD2Q92925 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMARCD2Q92925 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMARCD2Q92925 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMARCD2Q92925 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMARCD2Q92925 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMARCD2Q92925 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMARCD2Q92925 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMARCD2Q92925 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMARCD2Q92925 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMARCD2Q92925 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMARCD2Q92925 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMARCD2Q92925 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMARCD2Q92925 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMARCD2Q92925 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMARCD2Q92925 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMARCD2Q92925 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMARCD2Q92925 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMARCD2Q92925 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMARCD2Q92925 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMARCD2Q92925 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMARCD2Q92925 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMARCD2Q92925 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMARCD2Q92925 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMARCD2Q92925 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMARCD2Q92925 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMARCD2Q92925 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMARCD2Q92925 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMARCD2Q92925 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMARCD2Q92925 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMARCD2Q92925 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMARCD2Q92925 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMARCD2Q92925 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SMARCD2Q92925 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMARCD2Q92925 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMARCD2Q92925 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMARCD2Q92925 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMARCD2Q92925 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMARCD2Q92925 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMARCD2Q92925 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMARCD2Q92925 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMARCD2Q92925 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMARCD2Q92925 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMARCD2Q92925 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMARCD2Q92925 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SMARCD2Q92925 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMARCD2Q92925 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMARCD2Q92925 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms