Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HERVK_113Q902F9 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HERVK_113Q902F9 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HERVK_113Q902F9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HERVK_113Q902F9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HERVK_113Q902F9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HERVK_113Q902F9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HERVK_113Q902F9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HERVK_113Q902F9 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HERVK_113Q902F9 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HERVK_113Q902F9 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HERVK_113Q902F9 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HERVK_113Q902F9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HERVK_113Q902F9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HERVK_113Q902F9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HERVK_113Q902F9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HERVK_113Q902F9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HERVK_113Q902F9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HERVK_113Q902F9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HERVK_113Q902F9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HERVK_113Q902F9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HERVK_113Q902F9 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HERVK_113Q902F9 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HERVK_113Q902F9 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HERVK_113Q902F9 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HERVK_113Q902F9 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HERVK_113Q902F9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HERVK_113Q902F9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HERVK_113Q902F9 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HERVK_113Q902F9 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HERVK_113Q902F9 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HERVK_113Q902F9 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HERVK_113Q902F9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HERVK_113Q902F9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HERVK_113Q902F9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HERVK_113Q902F9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HERVK_113Q902F9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HERVK_113Q902F9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HERVK_113Q902F9 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HERVK_113Q902F9 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HERVK_113Q902F9 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HERVK_113Q902F9 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HERVK_113Q902F9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HERVK_113Q902F9 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HERVK_113Q902F9 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HERVK_113Q902F9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HERVK_113Q902F9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HERVK_113Q902F9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HERVK_113Q902F9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HERVK_113Q902F9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HERVK_113Q902F9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HERVK_113Q902F9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HERVK_113Q902F9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HERVK_113Q902F9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HERVK_113Q902F9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HERVK_113Q902F9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HERVK_113Q902F9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HERVK_113Q902F9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HERVK_113Q902F9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HERVK_113Q902F9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HERVK_113Q902F9 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HERVK_113Q902F9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HERVK_113Q902F9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HERVK_113Q902F9 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HERVK_113Q902F9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HERVK_113Q902F9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HERVK_113Q902F9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HERVK_113Q902F9 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HERVK_113Q902F9 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HERVK_113Q902F9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HERVK_113Q902F9 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HERVK_113Q902F9 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
HERVK_113Q902F9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HERVK_113Q902F9 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HERVK_113Q902F9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HERVK_113Q902F9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HERVK_113Q902F9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
HERVK_113Q902F9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HERVK_113Q902F9 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HERVK_113Q902F9 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
HERVK_113Q902F9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HERVK_113Q902F9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HERVK_113Q902F9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HERVK_113Q902F9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HERVK_113Q902F9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HERVK_113Q902F9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HERVK_113Q902F9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HERVK_113Q902F9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HERVK_113Q902F9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HERVK_113Q902F9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HERVK_113Q902F9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HERVK_113Q902F9 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HERVK_113Q902F9 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HERVK_113Q902F9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HERVK_113Q902F9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HERVK_113Q902F9 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HERVK_113Q902F9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HERVK_113Q902F9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HERVK_113Q902F9 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HERVK_113Q902F9 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms