Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4L8

CCDC24, Coiled-coil domain-containing protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC24Q8N4L8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC24Q8N4L8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC24Q8N4L8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC24Q8N4L8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC24Q8N4L8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC24Q8N4L8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC24Q8N4L8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC24Q8N4L8 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC24Q8N4L8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC24Q8N4L8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC24Q8N4L8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC24Q8N4L8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC24Q8N4L8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC24Q8N4L8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC24Q8N4L8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC24Q8N4L8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC24Q8N4L8 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC24Q8N4L8 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC24Q8N4L8 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC24Q8N4L8 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC24Q8N4L8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC24Q8N4L8 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC24Q8N4L8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC24Q8N4L8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC24Q8N4L8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC24Q8N4L8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC24Q8N4L8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC24Q8N4L8 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC24Q8N4L8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC24Q8N4L8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC24Q8N4L8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC24Q8N4L8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC24Q8N4L8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC24Q8N4L8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC24Q8N4L8 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC24Q8N4L8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC24Q8N4L8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC24Q8N4L8 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC24Q8N4L8 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC24Q8N4L8 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC24Q8N4L8 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC24Q8N4L8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC24Q8N4L8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC24Q8N4L8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC24Q8N4L8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC24Q8N4L8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC24Q8N4L8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC24Q8N4L8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC24Q8N4L8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC24Q8N4L8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC24Q8N4L8 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC24Q8N4L8 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC24Q8N4L8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC24Q8N4L8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC24Q8N4L8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC24Q8N4L8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC24Q8N4L8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC24Q8N4L8 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC24Q8N4L8 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC24Q8N4L8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC24Q8N4L8 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC24Q8N4L8 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC24Q8N4L8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC24Q8N4L8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC24Q8N4L8 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC24Q8N4L8 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC24Q8N4L8 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC24Q8N4L8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC24Q8N4L8 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC24Q8N4L8 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC24Q8N4L8 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC24Q8N4L8 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC24Q8N4L8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC24Q8N4L8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC24Q8N4L8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC24Q8N4L8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC24Q8N4L8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC24Q8N4L8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC24Q8N4L8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC24Q8N4L8 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC24Q8N4L8 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC24Q8N4L8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC24Q8N4L8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC24Q8N4L8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC24Q8N4L8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC24Q8N4L8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC24Q8N4L8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC24Q8N4L8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC24Q8N4L8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC24Q8N4L8 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC24Q8N4L8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC24Q8N4L8 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC24Q8N4L8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC24Q8N4L8 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC24Q8N4L8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC24Q8N4L8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC24Q8N4L8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC24Q8N4L8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC24Q8N4L8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC24Q8N4L8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms