Protein–RNA interactions for Protein: Q86Y13

DZIP3, E3 ubiquitin-protein ligase DZIP3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DZIP3Q86Y13 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DZIP3Q86Y13 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DZIP3Q86Y13 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DZIP3Q86Y13 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DZIP3Q86Y13 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DZIP3Q86Y13 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DZIP3Q86Y13 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DZIP3Q86Y13 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DZIP3Q86Y13 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DZIP3Q86Y13 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DZIP3Q86Y13 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DZIP3Q86Y13 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DZIP3Q86Y13 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
DZIP3Q86Y13 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
DZIP3Q86Y13 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
DZIP3Q86Y13 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
DZIP3Q86Y13 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
DZIP3Q86Y13 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
DZIP3Q86Y13 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
DZIP3Q86Y13 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
DZIP3Q86Y13 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
DZIP3Q86Y13 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
DZIP3Q86Y13 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DZIP3Q86Y13 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DZIP3Q86Y13 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DZIP3Q86Y13 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DZIP3Q86Y13 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DZIP3Q86Y13 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DZIP3Q86Y13 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DZIP3Q86Y13 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DZIP3Q86Y13 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
DZIP3Q86Y13 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
DZIP3Q86Y13 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DZIP3Q86Y13 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
DZIP3Q86Y13 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DZIP3Q86Y13 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
DZIP3Q86Y13 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
DZIP3Q86Y13 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
DZIP3Q86Y13 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
DZIP3Q86Y13 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
DZIP3Q86Y13 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
DZIP3Q86Y13 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
DZIP3Q86Y13 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
DZIP3Q86Y13 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
DZIP3Q86Y13 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
DZIP3Q86Y13 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DZIP3Q86Y13 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
DZIP3Q86Y13 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DZIP3Q86Y13 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DZIP3Q86Y13 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
DZIP3Q86Y13 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
DZIP3Q86Y13 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
DZIP3Q86Y13 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
DZIP3Q86Y13 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
DZIP3Q86Y13 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DZIP3Q86Y13 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DZIP3Q86Y13 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DZIP3Q86Y13 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DZIP3Q86Y13 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
DZIP3Q86Y13 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
DZIP3Q86Y13 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DZIP3Q86Y13 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DZIP3Q86Y13 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DZIP3Q86Y13 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DZIP3Q86Y13 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DZIP3Q86Y13 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DZIP3Q86Y13 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DZIP3Q86Y13 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DZIP3Q86Y13 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DZIP3Q86Y13 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
DZIP3Q86Y13 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
DZIP3Q86Y13 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DZIP3Q86Y13 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DZIP3Q86Y13 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DZIP3Q86Y13 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DZIP3Q86Y13 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DZIP3Q86Y13 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DZIP3Q86Y13 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DZIP3Q86Y13 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
DZIP3Q86Y13 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
DZIP3Q86Y13 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DZIP3Q86Y13 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
DZIP3Q86Y13 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
DZIP3Q86Y13 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
DZIP3Q86Y13 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
DZIP3Q86Y13 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DZIP3Q86Y13 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DZIP3Q86Y13 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DZIP3Q86Y13 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
DZIP3Q86Y13 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DZIP3Q86Y13 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DZIP3Q86Y13 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
DZIP3Q86Y13 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DZIP3Q86Y13 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DZIP3Q86Y13 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DZIP3Q86Y13 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
DZIP3Q86Y13 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DZIP3Q86Y13 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DZIP3Q86Y13 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
DZIP3Q86Y13 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms