Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC84Q86UT8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC84Q86UT8 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC84Q86UT8 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC84Q86UT8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC84Q86UT8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC84Q86UT8 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC84Q86UT8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC84Q86UT8 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC84Q86UT8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC84Q86UT8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC84Q86UT8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC84Q86UT8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC84Q86UT8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC84Q86UT8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC84Q86UT8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC84Q86UT8 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC84Q86UT8 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC84Q86UT8 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC84Q86UT8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC84Q86UT8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC84Q86UT8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC84Q86UT8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC84Q86UT8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC84Q86UT8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC84Q86UT8 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC84Q86UT8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC84Q86UT8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC84Q86UT8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC84Q86UT8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC84Q86UT8 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC84Q86UT8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC84Q86UT8 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC84Q86UT8 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC84Q86UT8 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC84Q86UT8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC84Q86UT8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC84Q86UT8 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC84Q86UT8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC84Q86UT8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC84Q86UT8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC84Q86UT8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC84Q86UT8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC84Q86UT8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC84Q86UT8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC84Q86UT8 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC84Q86UT8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC84Q86UT8 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC84Q86UT8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC84Q86UT8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC84Q86UT8 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC84Q86UT8 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC84Q86UT8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC84Q86UT8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC84Q86UT8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CCDC84Q86UT8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CCDC84Q86UT8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CCDC84Q86UT8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC84Q86UT8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC84Q86UT8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC84Q86UT8 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC84Q86UT8 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC84Q86UT8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC84Q86UT8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC84Q86UT8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC84Q86UT8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC84Q86UT8 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC84Q86UT8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC84Q86UT8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC84Q86UT8 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC84Q86UT8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC84Q86UT8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC84Q86UT8 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC84Q86UT8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC84Q86UT8 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC84Q86UT8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC84Q86UT8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC84Q86UT8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC84Q86UT8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC84Q86UT8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC84Q86UT8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC84Q86UT8 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC84Q86UT8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC84Q86UT8 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC84Q86UT8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC84Q86UT8 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC84Q86UT8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC84Q86UT8 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC84Q86UT8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC84Q86UT8 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC84Q86UT8 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC84Q86UT8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC84Q86UT8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC84Q86UT8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC84Q86UT8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC84Q86UT8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC84Q86UT8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC84Q86UT8 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC84Q86UT8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC84Q86UT8 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms