Protein–RNA interactions for Protein: Q86UA6

RPAIN, RPA-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAINQ86UA6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPAINQ86UA6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPAINQ86UA6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPAINQ86UA6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPAINQ86UA6 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPAINQ86UA6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RPAINQ86UA6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPAINQ86UA6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPAINQ86UA6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RPAINQ86UA6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RPAINQ86UA6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RPAINQ86UA6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RPAINQ86UA6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPAINQ86UA6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPAINQ86UA6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPAINQ86UA6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPAINQ86UA6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPAINQ86UA6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPAINQ86UA6 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPAINQ86UA6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPAINQ86UA6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPAINQ86UA6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RPAINQ86UA6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPAINQ86UA6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPAINQ86UA6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPAINQ86UA6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPAINQ86UA6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPAINQ86UA6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPAINQ86UA6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPAINQ86UA6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPAINQ86UA6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPAINQ86UA6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPAINQ86UA6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPAINQ86UA6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPAINQ86UA6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPAINQ86UA6 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RPAINQ86UA6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPAINQ86UA6 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPAINQ86UA6 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPAINQ86UA6 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RPAINQ86UA6 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RPAINQ86UA6 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RPAINQ86UA6 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RPAINQ86UA6 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RPAINQ86UA6 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RPAINQ86UA6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPAINQ86UA6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPAINQ86UA6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPAINQ86UA6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPAINQ86UA6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPAINQ86UA6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPAINQ86UA6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RPAINQ86UA6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPAINQ86UA6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPAINQ86UA6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPAINQ86UA6 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RPAINQ86UA6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPAINQ86UA6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPAINQ86UA6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPAINQ86UA6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPAINQ86UA6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPAINQ86UA6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPAINQ86UA6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPAINQ86UA6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPAINQ86UA6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPAINQ86UA6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPAINQ86UA6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPAINQ86UA6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPAINQ86UA6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPAINQ86UA6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPAINQ86UA6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPAINQ86UA6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPAINQ86UA6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPAINQ86UA6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPAINQ86UA6 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPAINQ86UA6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPAINQ86UA6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPAINQ86UA6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPAINQ86UA6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPAINQ86UA6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPAINQ86UA6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPAINQ86UA6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPAINQ86UA6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPAINQ86UA6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPAINQ86UA6 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RPAINQ86UA6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPAINQ86UA6 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPAINQ86UA6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPAINQ86UA6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPAINQ86UA6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPAINQ86UA6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPAINQ86UA6 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RPAINQ86UA6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPAINQ86UA6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPAINQ86UA6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPAINQ86UA6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPAINQ86UA6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPAINQ86UA6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPAINQ86UA6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPAINQ86UA6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms