Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAPPC6BQ86SZ2 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAPPC6BQ86SZ2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAPPC6BQ86SZ2 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAPPC6BQ86SZ2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAPPC6BQ86SZ2 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC6BQ86SZ2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC6BQ86SZ2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC6BQ86SZ2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC6BQ86SZ2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC6BQ86SZ2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC6BQ86SZ2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC6BQ86SZ2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC6BQ86SZ2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC6BQ86SZ2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC6BQ86SZ2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC6BQ86SZ2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC6BQ86SZ2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC6BQ86SZ2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC6BQ86SZ2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC6BQ86SZ2 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC6BQ86SZ2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC6BQ86SZ2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC6BQ86SZ2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC6BQ86SZ2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAPPC6BQ86SZ2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAPPC6BQ86SZ2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAPPC6BQ86SZ2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAPPC6BQ86SZ2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAPPC6BQ86SZ2 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAPPC6BQ86SZ2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAPPC6BQ86SZ2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAPPC6BQ86SZ2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAPPC6BQ86SZ2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAPPC6BQ86SZ2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAPPC6BQ86SZ2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAPPC6BQ86SZ2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAPPC6BQ86SZ2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAPPC6BQ86SZ2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAPPC6BQ86SZ2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAPPC6BQ86SZ2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAPPC6BQ86SZ2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAPPC6BQ86SZ2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAPPC6BQ86SZ2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAPPC6BQ86SZ2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAPPC6BQ86SZ2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAPPC6BQ86SZ2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAPPC6BQ86SZ2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRAPPC6BQ86SZ2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRAPPC6BQ86SZ2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRAPPC6BQ86SZ2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRAPPC6BQ86SZ2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRAPPC6BQ86SZ2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC6BQ86SZ2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC6BQ86SZ2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC6BQ86SZ2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC6BQ86SZ2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC6BQ86SZ2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC6BQ86SZ2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC6BQ86SZ2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC6BQ86SZ2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC6BQ86SZ2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC6BQ86SZ2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC6BQ86SZ2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC6BQ86SZ2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC6BQ86SZ2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC6BQ86SZ2 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC6BQ86SZ2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC6BQ86SZ2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC6BQ86SZ2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC6BQ86SZ2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC6BQ86SZ2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC6BQ86SZ2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC6BQ86SZ2 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC6BQ86SZ2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC6BQ86SZ2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC6BQ86SZ2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAPPC6BQ86SZ2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAPPC6BQ86SZ2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAPPC6BQ86SZ2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAPPC6BQ86SZ2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAPPC6BQ86SZ2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAPPC6BQ86SZ2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAPPC6BQ86SZ2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAPPC6BQ86SZ2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAPPC6BQ86SZ2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAPPC6BQ86SZ2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAPPC6BQ86SZ2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAPPC6BQ86SZ2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAPPC6BQ86SZ2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms