Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z569

BRAP, BRCA1-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAPQ7Z569 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRAPQ7Z569 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRAPQ7Z569 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
BRAPQ7Z569 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
BRAPQ7Z569 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
BRAPQ7Z569 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
BRAPQ7Z569 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRAPQ7Z569 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRAPQ7Z569 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BRAPQ7Z569 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
BRAPQ7Z569 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRAPQ7Z569 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRAPQ7Z569 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRAPQ7Z569 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRAPQ7Z569 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRAPQ7Z569 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRAPQ7Z569 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRAPQ7Z569 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRAPQ7Z569 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRAPQ7Z569 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BRAPQ7Z569 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BRAPQ7Z569 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BRAPQ7Z569 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BRAPQ7Z569 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BRAPQ7Z569 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BRAPQ7Z569 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BRAPQ7Z569 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BRAPQ7Z569 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BRAPQ7Z569 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
BRAPQ7Z569 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
BRAPQ7Z569 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
BRAPQ7Z569 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
BRAPQ7Z569 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
BRAPQ7Z569 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRAPQ7Z569 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRAPQ7Z569 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRAPQ7Z569 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRAPQ7Z569 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRAPQ7Z569 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRAPQ7Z569 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRAPQ7Z569 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRAPQ7Z569 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRAPQ7Z569 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRAPQ7Z569 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRAPQ7Z569 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRAPQ7Z569 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRAPQ7Z569 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
BRAPQ7Z569 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRAPQ7Z569 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRAPQ7Z569 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRAPQ7Z569 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRAPQ7Z569 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRAPQ7Z569 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRAPQ7Z569 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRAPQ7Z569 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRAPQ7Z569 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRAPQ7Z569 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRAPQ7Z569 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRAPQ7Z569 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRAPQ7Z569 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRAPQ7Z569 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRAPQ7Z569 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRAPQ7Z569 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
BRAPQ7Z569 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRAPQ7Z569 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRAPQ7Z569 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRAPQ7Z569 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRAPQ7Z569 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRAPQ7Z569 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRAPQ7Z569 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRAPQ7Z569 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRAPQ7Z569 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRAPQ7Z569 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRAPQ7Z569 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRAPQ7Z569 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRAPQ7Z569 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
BRAPQ7Z569 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRAPQ7Z569 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRAPQ7Z569 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRAPQ7Z569 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRAPQ7Z569 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRAPQ7Z569 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRAPQ7Z569 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRAPQ7Z569 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRAPQ7Z569 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRAPQ7Z569 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRAPQ7Z569 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRAPQ7Z569 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRAPQ7Z569 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRAPQ7Z569 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
BRAPQ7Z569 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRAPQ7Z569 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRAPQ7Z569 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRAPQ7Z569 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRAPQ7Z569 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRAPQ7Z569 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
BRAPQ7Z569 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRAPQ7Z569 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRAPQ7Z569 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRAPQ7Z569 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms