Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA2D4Q7Z3S7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA2D4Q7Z3S7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA2D4Q7Z3S7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA2D4Q7Z3S7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA2D4Q7Z3S7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA2D4Q7Z3S7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNA2D4Q7Z3S7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNA2D4Q7Z3S7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNA2D4Q7Z3S7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNA2D4Q7Z3S7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNA2D4Q7Z3S7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNA2D4Q7Z3S7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNA2D4Q7Z3S7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNA2D4Q7Z3S7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNA2D4Q7Z3S7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNA2D4Q7Z3S7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNA2D4Q7Z3S7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNA2D4Q7Z3S7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNA2D4Q7Z3S7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNA2D4Q7Z3S7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNA2D4Q7Z3S7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNA2D4Q7Z3S7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNA2D4Q7Z3S7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNA2D4Q7Z3S7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNA2D4Q7Z3S7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNA2D4Q7Z3S7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNA2D4Q7Z3S7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNA2D4Q7Z3S7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNA2D4Q7Z3S7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNA2D4Q7Z3S7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNA2D4Q7Z3S7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNA2D4Q7Z3S7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CACNA2D4Q7Z3S7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CACNA2D4Q7Z3S7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CACNA2D4Q7Z3S7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CACNA2D4Q7Z3S7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CACNA2D4Q7Z3S7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CACNA2D4Q7Z3S7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CACNA2D4Q7Z3S7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CACNA2D4Q7Z3S7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CACNA2D4Q7Z3S7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CACNA2D4Q7Z3S7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CACNA2D4Q7Z3S7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CACNA2D4Q7Z3S7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CACNA2D4Q7Z3S7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CACNA2D4Q7Z3S7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CACNA2D4Q7Z3S7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNA2D4Q7Z3S7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNA2D4Q7Z3S7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNA2D4Q7Z3S7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNA2D4Q7Z3S7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNA2D4Q7Z3S7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNA2D4Q7Z3S7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNA2D4Q7Z3S7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNA2D4Q7Z3S7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNA2D4Q7Z3S7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNA2D4Q7Z3S7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNA2D4Q7Z3S7 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNA2D4Q7Z3S7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNA2D4Q7Z3S7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNA2D4Q7Z3S7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNA2D4Q7Z3S7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNA2D4Q7Z3S7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNA2D4Q7Z3S7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNA2D4Q7Z3S7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNA2D4Q7Z3S7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNA2D4Q7Z3S7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNA2D4Q7Z3S7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNA2D4Q7Z3S7 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNA2D4Q7Z3S7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNA2D4Q7Z3S7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNA2D4Q7Z3S7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNA2D4Q7Z3S7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNA2D4Q7Z3S7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNA2D4Q7Z3S7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNA2D4Q7Z3S7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNA2D4Q7Z3S7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNA2D4Q7Z3S7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNA2D4Q7Z3S7 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNA2D4Q7Z3S7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNA2D4Q7Z3S7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNA2D4Q7Z3S7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNA2D4Q7Z3S7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNA2D4Q7Z3S7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNA2D4Q7Z3S7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNA2D4Q7Z3S7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNA2D4Q7Z3S7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNA2D4Q7Z3S7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNA2D4Q7Z3S7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms