Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAF7Q6Q0C0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAF7Q6Q0C0 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAF7Q6Q0C0 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAF7Q6Q0C0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAF7Q6Q0C0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAF7Q6Q0C0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAF7Q6Q0C0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAF7Q6Q0C0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAF7Q6Q0C0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAF7Q6Q0C0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAF7Q6Q0C0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAF7Q6Q0C0 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAF7Q6Q0C0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAF7Q6Q0C0 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAF7Q6Q0C0 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAF7Q6Q0C0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAF7Q6Q0C0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAF7Q6Q0C0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAF7Q6Q0C0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAF7Q6Q0C0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAF7Q6Q0C0 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAF7Q6Q0C0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAF7Q6Q0C0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAF7Q6Q0C0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAF7Q6Q0C0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAF7Q6Q0C0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAF7Q6Q0C0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAF7Q6Q0C0 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAF7Q6Q0C0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAF7Q6Q0C0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAF7Q6Q0C0 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAF7Q6Q0C0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAF7Q6Q0C0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAF7Q6Q0C0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAF7Q6Q0C0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAF7Q6Q0C0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAF7Q6Q0C0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRAF7Q6Q0C0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRAF7Q6Q0C0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAF7Q6Q0C0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAF7Q6Q0C0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAF7Q6Q0C0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAF7Q6Q0C0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAF7Q6Q0C0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAF7Q6Q0C0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAF7Q6Q0C0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAF7Q6Q0C0 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAF7Q6Q0C0 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAF7Q6Q0C0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAF7Q6Q0C0 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAF7Q6Q0C0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAF7Q6Q0C0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAF7Q6Q0C0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAF7Q6Q0C0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAF7Q6Q0C0 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAF7Q6Q0C0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAF7Q6Q0C0 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAF7Q6Q0C0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAF7Q6Q0C0 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAF7Q6Q0C0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAF7Q6Q0C0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAF7Q6Q0C0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAF7Q6Q0C0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAF7Q6Q0C0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAF7Q6Q0C0 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAF7Q6Q0C0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAF7Q6Q0C0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAF7Q6Q0C0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAF7Q6Q0C0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAF7Q6Q0C0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAF7Q6Q0C0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAF7Q6Q0C0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAF7Q6Q0C0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAF7Q6Q0C0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAF7Q6Q0C0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAF7Q6Q0C0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAF7Q6Q0C0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAF7Q6Q0C0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAF7Q6Q0C0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAF7Q6Q0C0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAF7Q6Q0C0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAF7Q6Q0C0 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAF7Q6Q0C0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAF7Q6Q0C0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAF7Q6Q0C0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAF7Q6Q0C0 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAF7Q6Q0C0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAF7Q6Q0C0 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAF7Q6Q0C0 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAF7Q6Q0C0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAF7Q6Q0C0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAF7Q6Q0C0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAF7Q6Q0C0 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAF7Q6Q0C0 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAF7Q6Q0C0 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAF7Q6Q0C0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAF7Q6Q0C0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAF7Q6Q0C0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAF7Q6Q0C0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms