Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIL6

KCNIP4, Kv channel-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP4Q6PIL6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNIP4Q6PIL6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNIP4Q6PIL6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNIP4Q6PIL6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNIP4Q6PIL6 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNIP4Q6PIL6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNIP4Q6PIL6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNIP4Q6PIL6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNIP4Q6PIL6 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNIP4Q6PIL6 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNIP4Q6PIL6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNIP4Q6PIL6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms